ANÁLISE DE GENES 16S rDNA DA RIZOSFERA DE GUAVIRA. Campomanesia adamantium O. Berg

O objetivo do presente trabalho foi a caracterização da comunidade de micro-organismos habitantes da rizosfera planta medicinal C. adamantium utilizando-se tecnologia de sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática. O trabalho visa identificar os principais micro-organismos presentes na região da rizosfera da planta, comparando aos organismos relativos ao mesmo ambiente mas sem associação à rizosfera, de forma a se definir aqueles que estão super-representado nessas regiões, além de predizer a funcionalidade desses micro-organismos. Os solos foram coletados no Horto da UFGD/Dourados – Mato Grosso do Sul em extraindo-se desses solos o material genético (DNA) em três réplicas técnicas. O DNA foi sequenciado pela LBMP (Laboratório de Bioquímica de Micro-organismos e Plantas) de Jaboticabal/SP através da tecnologia Ion Semiconductor. As sequências foram analisadas através da pipeline sugerida pelo Brazilian Microbiome Project, definindo-se, a partir da clusterização das 267 OTUs, quais são os micro-organismos presentes nos ambientes.

本研究旨在借助新一代测序技术与生物信息学分析手段，对药用植物C. adamantium根际的微生物群落进行表征。本研究拟明确该植物根际区域的优势微生物类群，将其与同环境下非根际的相关微生物进行对比，以确定在根际区域中显著富集的微生物类群，并对这些微生物的功能进行预测。土壤样品采集自南马托格罗索州杜拉多斯市UFGD植物园，从采集的土壤中提取基因组DNA（脱氧核糖核酸），设置3次技术重复。基因组DNA由圣保罗州雅博蒂卡瓦尔市的LBMP（微生物与植物生物化学实验室，Laboratório de Bioquímica de Micro-organismos e Plantas）采用Ion Semiconductor离子半导体测序技术完成测序。测序所得序列采用巴西微生物组计划（Brazilian Microbiome Project）推荐的分析流程进行解析，通过对267个OTU（操作分类单元，Operational Taxonomic Unit）进行聚类分析，明确不同生境中存在的微生物类群。