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The crystal structure of RibD from Escherichia coli in complex with a substrate analogue, ribose 5-phosphate (beta form), bound to the active site of the reductase domain

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Protein Data Bank Japan2024-11-13 更新2026-03-21 收录
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The crystal structure of RibD from Escherichia coli in complex with a substrate analogue, ribose 5-phosphate (beta form), bound to the active site of the reductase domain Descriptor: 5-O-phosphono-beta-D-ribofuranose, Riboflavin biosynthesis protein ribD Authors: Moche, M, Stenmark, P, Gurmu, D, Nordlund, P, Structural Proteomics in Europe (SPINE) Deposit date: 2006-12-18 Release date: 2007-02-13 Last modified: 2024-11-13 Method: X-RAY DIFFRACTION (3 Å) Cite: The crystal structure of the bifunctional deaminase/reductase RibD of the riboflavin biosynthetic pathway in Escherichia coli: implications for the reductive mechanism. J.Mol.Biol., 373, 2007

本数据集为大肠杆菌(Escherichia coli)来源的RibD蛋白晶体结构,该蛋白与结合在其还原酶结构域活性位点的底物类似物β型5-磷酸核糖形成复合物,对应标准化学配体为β-D-呋喃核糖-5-磷酸(5-O-phosphono-beta-D-ribofuranose)。该蛋白为核黄素生物合成蛋白ribD。 作者:Moche, M、Stenmark, P、Gurmu, D、Nordlund, P,欧洲结构蛋白质组学计划(Structural Proteomics in Europe, SPINE) 提交日期:2006年12月18日 发布日期:2007年2月13日 最后修改日期:2024年11月13日 实验方法:X射线衍射(X-RAY DIFFRACTION),分辨率3 Å 引用文献:《大肠杆菌核黄素生物合成途径双功能脱氨酶/还原酶RibD的晶体结构:对还原机制的启示》,J.Mol.Biol.,第373卷,2007年
创建时间:
2006-12-18
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