Examples of carbohydrases and CBM proteins detected in S. degradans supernatants by mass spectrometry.

1Protein was detected in supernatants of cultures grown in the following growth substrates: Avicel (��70% crystalline cellulose), xylan (Birchwood glucuronoarabinoxylan).2Predictions of function and module determination utilizing the routines used for the updates of the CAZy database (www.cazy.org/CAZY/).3Module abbreviations: CBM, carbohydrate binding module; UNK, unknown function; PSL, polyserine linker; LPB, lipobox signature sequence; GH, glycosyl hydrolase; EPR, glutamate-proline rich region.4Gene number having the prefix ��Sde��, for Saccharophagus degradans as assigned in Jun 15, 2005 genome assembly5MW and amino acid count calculated using the protParam tool at http://us.expasy.org/tools/ based on DOE/JGI gene model amino acid sequence translations including any predicted signal peptide.

1 在以如下生长底物培养的培养液上清中检测到蛋白质：Avicel（含≥70%结晶纤维素）、木聚糖（Birchwood glucuronoarabinoxylan，桦木糖醛酸阿拉伯木聚糖）。
2 功能预测与模块注释采用了用于更新CAZy数据库（www.cazy.org/CAZY/）的标准分析流程。
3 模块缩写说明：CBM（carbohydrate binding module，碳水化合物结合模块）、UNK（unknown function，未知功能）、PSL（polyserine linker，聚丝氨酸接头）、LPB（lipobox signature sequence，脂盒特征序列）、GH（glycosyl hydrolase，糖苷水解酶）、EPR（glutamate-proline rich region，富谷氨酸-脯氨酸区域）。
4 以"Sde"为前缀的基因编号，对应2005年6月15日发布的基因组组装版本中注释的Saccharophagus degradans（糖噬降解单胞菌）。
5 分子量（MW）与氨基酸残基总数基于DOE/JGI基因模型的氨基酸序列翻译结果（包含所有预测的信号肽），通过http://us.expasy.org/tools/ 站点的protParam工具计算得到。