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HG006_Father (GIAB_ChineseTrio_10X)

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NIAID Data Ecosystem2026-03-14 收录
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This is a sub-sampled version (10X) of ChineseTrio HG006(father) fastq files published by NIST's Genome in a Bottle project. We created them for practicing variant-call processes. These files are 10X fastq files. Though 30X fastq files are preferable for WGS analysis, we prepared 10X fastq files for reducing the burden of handling the large files. The original data is available under:https://github.com/genome-in-a-bottle/giab_data_indexes The original article is below; Wang, YC., Olson, N.D., Deikus, G. et al. High-coverage, long-read sequencing of Han Chinese trio reference samples. Sci Data 6, 91 (2019). https://doi.org/10.1038/s41597-019-0098-2 We are permitted to published sub-sampled versions by Genome in a Bottle project.

本数据集为美国国家标准与技术研究院(National Institute of Standards and Technology, NIST)“基因组在瓶中”(Genome in a Bottle, GIAB)项目发布的ChineseTrio HG006(父亲样本)fastq文件的10倍下采样版本。我们制作该数据集用于变异位点检测流程的练习实践。 本次提供的为10倍深度fastq文件。尽管全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)分析更推荐使用30倍深度的fastq文件,但我们为降低大文件处理的负担,制备了该10倍下采样版本。 原始数据集可通过以下链接获取:https://github.com/genome-in-a-bottle/giab_data_indexes 相关原始文献如下: Wang YC、Olson ND、Deikus G 等. 汉族三人组参考样本的高覆盖度长读长测序. 《科学数据(Sci Data)》, 2019, 6:91. https://doi.org/10.1038/s41597-019-0098-2 本数据集的下采样版本已获“基因组在瓶中”项目授权发布。
创建时间:
2022-11-11
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