Flye assemblies (long-read only assemblies)
收藏DataCite Commons2025-05-26 更新2024-07-28 收录
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资源简介：
Flye (version 2.8.3-b1695) [31] was run with all the passed ONT reads (phred score > 7) available per barcode (--nano-raw), specifying the option to recover plasmids (--plasmids), indicating an expected genome size of 5 Mbp (--genome-size 5m) and considering 3 polishing rounds (--iterations 3). <br>ONT reads were demultiplexed and basecalled using Guppy (version 4.2.3). <br>
Flye（版本2.8.3-b1695）[31] 针对每个条形码对应的所有Phred质量值大于7的合格ONT（Oxford Nanopore Technologies，牛津纳米孔测序）读段，采用--nano-raw参数运行，开启恢复质粒的配置选项（--plasmids），设置预期基因组大小为5 Mbp（--genome-size 5m），并配置3轮抛光迭代（--iterations 3）。
ONT读段已通过Guppy（版本4.2.3）完成分样与碱基识别。
提供机构：
figshare
创建时间：
2021-05-31
