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SQLite database with MGI mouse gene annotations from Mouse Genome Informatics (MGI) at The Jackson Laboratory

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DataCite Commons2020-09-01 更新2024-07-25 收录
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资源简介:
A SQLite database with two tables: "description" and "genes". The description table includes the URL for the source file. The "genes" table contains the data, with 14 fields including chr (1-19, X, Y, MT), start and stop (in basepairs, GRCm38/mm10 build), source, strand, Name, and type.<br>This is like mouse_genes.sqlite, but just with the records with source=="MGI".

本数据集为包含两张数据表的SQLite数据库,数据表分别命名为"description"与"genes"。其中"description"表存储了源文件的URL地址。"genes"表存储核心数据信息,共包含14个字段,具体包括:chr(取值覆盖1-19号常染色体、X染色体、Y染色体及线粒体MT)、起始与终止位点(单位为碱基对,采用GRCm38/mm10参考基因组构建版本)、source(数据来源)、strand(链方向)、Name(基因名称)以及type(字段类型)。本数据集与"mouse_genes.sqlite"结构类似,但仅保留了"source"字段值为"MGI"的记录。
提供机构:
figshare
创建时间:
2017-08-08
5,000+
优质数据集
54 个
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