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Transcriptome references and alignment statistics.

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NIAID Data Ecosystem2026-03-09 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/_Transcriptome_references_and_alignment_statistics_/1242652
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For each transcriptome reference used in this study, the name of the species, the number of genes available, and the number of transcripts available are indicated. *The number of available transcripts indicated for the Chinese hamster ovary cells represents the number of available transcript fragments available and not the number of distinct transcripts. Moreover, for each transcriptome reference used in this study, the number of aligned contigs and singletons, the number of mapped transcripts and the number of mapped genes are indicated. The percentages of mapped transcripts and mapped genes relative to the total number of transcripts and genes available on the transcriptome references are provided. Moreover the percentage of alignments relative to the total number of contigs and singletons in our library (174,278) is also provided. Transcriptome references and alignment statistics.

本研究中使用的每一套转录组参考序列,均标注了对应物种名称、可用基因数量以及可用转录本数量。 * 中国仓鼠卵巢细胞的可用转录本数量标注的是可用转录片段的数量,而非独立转录本的数量。此外,本研究中使用的每一套转录组参考序列,均标注了比对上的重叠群(contigs)与单序列(singletons)数量、比对上的转录本数量以及比对上的基因数量。同时给出了比对上的转录本、基因数量相较于转录组参考序列中总转录本与总基因数量的占比。此外,还给出了比对序列相较于本研究文库中总重叠群与单序列数量(174,278)的占比。 转录组参考序列及比对统计结果。
创建时间:
2014-11-14
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