VAMB Benchmark Datasets
收藏Figshare2020-11-11 更新2026-04-08 收录
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资源简介：
CAMI2 and MetaHIT benchmark datasets for input to VAMB. These are the datasets used in the paper and for each dataset the file contains:<br>- Contigs (contigs.fna.gz)- Abundance estimation of each contig x sample in Numpy npc format (abundance.npz)- Reference information on the source of each contig (reference.tsv)- Taxonomy of each OTU in the dataset (taxonomy.tsv)<br><br>
用于VAMB输入的CAMI2与MetaHIT基准数据集。本数据集为论文中所使用的实验数据集，每个数据集对应的文件包含以下内容：
- 重叠群文件：contigs.fna.gz
- 各重叠群在各样本中的丰度估计值，采用Numpy npz格式存储（对应文件为abundance.npz）
- 各重叠群来源的参考信息：reference.tsv
- 数据集中每个操作分类单元（OTU, Operational Taxonomic Unit）的分类学信息：taxonomy.tsv
创建时间：
2020-11-11
