Scaled counts of trichome mRNA-seq from the 20 accessions

<strong>mRNA-seq scaled counts from stem trichomes of the 20 accessions. </strong> Pipeline: rnaseq-analysis-kallisto-sleuth: release v0.2.2 https://github.com/BleekerLab/rnaseq-analysis-kallisto-sleuth/releases Transcriptome used: S. lycopersicum ITAG4.0 cDNA <strong>Table of genotypes</strong> <pre><code class="language-markdown">| accession | species | accession nr | synonym | origin | |------------|--------------------------------|--------------|---------|-------------| | LA2172 | S. arcanum | TR0009 | - | Peru | | LA1401* | S. cheesmaniae f. minor | EA00652 | - | Ecuador | | LA1840 | S. chmielewskii | - | - | unknown | | LA2695 | S. chmielewskii | EA00759 | - | Peru | | LA0407 | S. habrochaites f. glabratum | EA00558 | - | Ecuador | | LA1777 | S. habrochaites f. hirsutum | EA00703 | - | Peru | | PI134418 | S. habrochaites f. glabratum | TR00015 | LYC38 | unknown | | LYC4 | S. habrochaites f. hirsutum | TR00017 | - | unknown | | LA1718 | S. habrochaites f. glabratum | EA00699 | LYC4934 | Peru | | PI127826 | S. habrochaites f. hirsutum | - | - | Peru | | LA1364 | S. huaylasense | TR00030 | - | Peru | | Moneymaker | S. lycopersicum | - | C32 | Netherlands | | LA4024 | S. lycopersicum | TA209 | - | unknown | | LA2133 | S. neorickii/L. parviflorum | EA00729 | - | Peru | | LA0735 | S. neorickii | TR00025 | LYC140 | unknown | | LA0716 | S. pennellii | EA00585 | - | Peru | | LA1278 | S. peruvianum/pimpinellifolium | TR00005 | - | unknown | | LA1954 | S. peruvianum | EA00713 | - | Peru | | LA1578 | S. pimpinellifolium | EA00674 | - | Peru |</code></pre>本数据集包含20份种质的茎表皮毛干细胞的mRNA测序（mRNA-seq）标准化计数数据。分析流程：rnaseq-analysis-kallisto-sleuth，版本号v0.2.2，官方发布地址：https://github.com/BleekerLab/rnaseq-analysis-kallisto-sleuth/releases。所用参考转录组为栽培番茄（Solanum lycopersicum）ITAG4.0的cDNA序列。 ### 基因型一览表 markdown | 种质编号 | 物种 | 种质登记号 | 别名 | 来源地 | |----------|--------------------------------|--------------|---------|-------------| | LA2172 | 神秘番茄（S. arcanum） | TR0009 | - | 秘鲁 | | LA1401* | 小果实秘鲁番茄（S. cheesmaniae f. minor） | EA00652 | - | 厄瓜多尔 | | LA1840 | 奇莫斯基番茄（S. chmielewskii） | - | - | 未知 | | LA2695 | 奇莫斯基番茄（S. chmielewskii） | EA00759 | - | 秘鲁 | | LA0407 | 光滑毛番茄（S. habrochaites f. glabratum） | EA00558 | - | 厄瓜多尔 | | LA1777 | 多毛番茄（S. habrochaites f. hirsutum） | EA00703 | - | 秘鲁 | | PI134418 | 光滑毛番茄（S. habrochaites f. glabratum） | TR00015 | LYC38 | 未知 | | LYC4 | 多毛番茄（S. habrochaites f. hirsutum） | TR00017 | - | 未知 | | LA1718 | 光滑毛番茄（S. habrochaites f. glabratum） | EA00699 | LYC4934 | 秘鲁 | | PI127826 | 多毛番茄（S. habrochaites f. hirsutum） | - | - | 秘鲁 | | LA1364 | 瓦拉斯番茄（S. huaylasense） | TR00030 | - | 秘鲁 | | Moneymaker | 普通番茄（S. lycopersicum） | - | C32 | 荷兰 | | LA4024 | 普通番茄（S. lycopersicum） | TA209 | - | 未知 | | LA2133 | 新里克番茄/小花番茄（S. neorickii/L. parviflorum） | EA00729 | - | 秘鲁 | | LA0735 | 新里克番茄（S. neorickii） | TR00025 | LYC140 | 未知 | | LA0716 | 彭南特番茄（S. pennellii） | EA00585 | - | 秘鲁 | | LA1278 | 秘鲁番茄/醋栗番茄（S. peruvianum/pimpinellifolium） | TR00005 | - | 未知 | | LA1954 | 秘鲁番茄（S. peruvianum） | EA00713 | - | 秘鲁 | | LA1578 | 醋栗番茄（S. pimpinellifolium） | EA00674 | - | 秘鲁 |