Environmental samples - Bioinformatics pipeline
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This repository includes: Raw sequencing dataHigh-throughput 16S rRNA gene amplicon sequencing data from environmental samples. Manifest fileMetadata and file mapping required for sequence processing (e.g., sample IDs, file paths, sequencing direction), formatted for compatibility with bioinformatics pipelines. Bioinformatics pipelineScripts and workflows used for sequence processing and analysis, including: Quality control and filtering Feature table construction Taxonomic assignment Diversity analyses
本代码仓库包含以下内容： 原始测序数据：来源于环境样本的高通量16S rRNA基因扩增子测序数据。 清单文件：序列处理所需的元数据与文件映射信息（例如样本ID、文件路径、测序方向），格式适配生物信息学分析流程。 生物信息学分析流程：用于序列处理与分析的脚本及工作流，具体包括： - 质量控制与过滤 - 特征表构建 - 物种分类注释 - 多样性分析
提供机构：
Zenodo创建时间：
2026-05-04
