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Multiple sequence alignment of P. aeruginosa TpbA.

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Figshare2015-12-03 更新2026-04-29 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Structural_and_Biochemical_Analysis_of_Tyrosine_Phosphatase_Related_to_Biofilm_Formation_A_TpbA_from_the_Opportunistic_Pathogen_Pseudomonas_aeruginosa_PAO1/1394412
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Key: P. aeruginosa, Pseudomonas aeruginosa PAO1; P. fluorescens, Pseudomonas fluorescens (sequence identity 52%); P. mendocina, Pseudomonas mendocina (sequence identity 49%); Geobacter, Geobacter metallireducens (sequence identity 31%); Acinetobacter, Acinetobacter baumannii (sequence identity 27%); Desulfococcus, Desulfococcus oleovorans (sequence identity 31%); Burkholderia, Burkholderia cepacia (sequence identity 40%); LKHP9428, Homo sapiens LKHP9428 (sequence identity 47%). Sequence alignment was generated by CLUSTAL O and visualized by ESPript. Secondary structure elements are shown for P. aeruginosa TpbA above the alignment. (PDF)

关键信息:铜绿假单胞菌(P. aeruginosa)对应铜绿假单胞菌PAO1(Pseudomonas aeruginosa PAO1);荧光假单胞菌(P. fluorescens)对应荧光假单胞菌,序列一致性为52%;门多萨假单胞菌(P. mendocina)对应门多萨假单胞菌,序列一致性为49%;地杆菌属(Geobacter)对应金属还原地杆菌(Geobacter metallireducens),序列一致性为31%;不动杆菌属(Acinetobacter)对应鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii),序列一致性为27%;脱硫球菌属(Desulfococcus)对应食烃脱硫球菌(Desulfococcus oleovorans),序列一致性为31%;伯克霍尔德菌属(Burkholderia)对应洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia cepacia),序列一致性为40%;LKHP9428对应人源LKHP9428,序列一致性为47%。本序列联配由CLUSTAL O生成,并通过ESPript完成可视化。序列联配上方已标注铜绿假单胞菌TpbA的二级结构元件。(PDF)
创建时间:
2015-12-03
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