DENV-1 DIII-E106 Fab structural interface.

The structural interface of DENV-1 DIII-E106 Fab (described by the surface area of antibody, Aba and antigen, Agb that is buried [24] as well as shape complementarity, Scc in the complex [23]) is compared to previously determined anti-DENV and anti-WNV Fab complexes. PDB codes E16 – WNV E DIII, 1ZTX [20]; 1A1D-2 – DENV2 E DIII, 2R29 [21]; E53 – WNV E, 3I50 [43]; E111 – DENV1 E DIII, 4FFY [33]; 2H12 – DENV1 DIII, 4AL8 [17]; 2H12 – DENV3 DIII, 4ALA [17]; 2H12 – DENV4 DIII, 4AM0 [17]; 4E11 – DENV1 DIII, 3UZQ [10]; 4E11 – DENV2 DIII, 3UZV [10]; 4E11 – DENV3 DIII, 3UZE [10]; 4E11 – DENV4 DIII, 3UYP [10].

登革病毒1型（DENV-1）DIII-E106抗原结合片段（Fab）的结构界面，以抗体埋藏表面积（Aba）与抗原埋藏表面积（Agb）[24]以及该复合物中的形状互补性（Scc）[23]进行表征，并将其与已解析的抗登革病毒及抗西尼罗河病毒（West Nile Virus, WNV）Fab复合物进行对比。所用蛋白质数据库（Protein Data Bank, PDB）编号对应如下：E16——西尼罗河病毒包膜蛋白DIII（1ZTX [20]）；1A1D-2——登革病毒2型包膜蛋白DIII（2R29 [21]）；E53——西尼罗河病毒包膜蛋白（3I50 [43]）；E111——登革病毒1型包膜蛋白DIII（4FFY [33]）；2H12——登革病毒1型DIII（4AL8 [17]）；2H12——登革病毒3型DIII（4ALA [17]）；2H12——登革病毒4型DIII（4AM0 [17]）；4E11——登革病毒1型DIII（3UZQ [10]）；4E11——登革病毒2型DIII（3UZV [10]）；4E11——登革病毒3型DIII（3UZE [10]）；4E11——登革病毒4型DIII（3UYP [10]）。