Pohlia nutans NO.L (Mosses ASM2249680v1)

High scoring set 1326 tRNAs decoding standard 20 AA 1326 Selenocysteine tRNAs (TCA) 0 Notable atypical predictions Anticodon/isotype mismatch 368 Unexpected anticodons 2 Other tRNA-like predictions Primary filter (tRNAscan-SE pseudogenes) 139 Secondary filter (low feature scores, possible rep. element) 1653 Gly GCC 1 Ser CGA 1 Leu CAA 1 Met CAT 17 Tyr GTA 20 Isotype tRNA Count by Anticodon Total Ala AGC 30 GGC CGC 14 TGC 13 57 Gly ACC GCC 42 CCC 10 TCC 20 72 Pro AGG 23 GGG CGG 10 TGG 11 44 Thr AGT 14 GGT CGT 13 TGT 87 114 Val AAC 24 GAC CAC 31 TAC 6 61 Isotype tRNA Count by Anticodon Total Ser AGA 23 GGA 81 CGA 15 TGA 74 ACT GCT 88 281 Arg ACG 19 GCG CCG 9 TCG 12 CCT 8 TCT 11 59 Leu AAG 14 GAG CAG 14 TAG 11 CAA 22 TAA 8 69 Isotype tRNA Count by Anticodon Total Phe AAA GAA 38 38 Asn ATT GTT 165 165 Lys CTT 29 TTT 18 47 Asp ATC GTC 34 34 Glu CTC 20 TTC 16 36 His ATG GTG 17 17 Gln CTG 23 TTG 10 33 Isotype tRNA Count by Anticodon Total Ile AAT 28 GAT CAT TAT 17 45 iMet/Met CAT 19/18 37 Tyr ATA GTA 20 20 Supres TCA CTA TTA 0 Cys ACA GCA 76 76 Trp CCA 21 21 SelCys TCA 0

本高分数据集共包含1326条可解码标准20种氨基酸的转运RNA（transfer RNA, tRNA），以及0条硒半胱氨酸（Selenocysteine, Sec）tRNA（反密码子为TCA）。
值得关注的非典型预测结果包括：反密码子-亚型错配368条、意外反密码子2条，以及其他类tRNA预测结果。
筛选流程如下：
1. 一级筛选（基于tRNAscan-SE工具鉴定的假基因）：139条
2. 二级筛选（特征分数较低、疑似重复元件）：1653条
初步计数结果：甘氨酸（Gly）tRNA（反密码子GCC）1条、丝氨酸（Ser）tRNA（反密码子CGA）1条、亮氨酸（Leu）tRNA（反密码子CAA）1条、甲硫氨酸（Met）tRNA（反密码子CAT）17条、酪氨酸（Tyr）tRNA（反密码子GTA）20条。
按亚型-反密码子分类的tRNA数量统计：
- 丙氨酸（Ala）tRNA：反密码子AGC 30条、CGC 14条、TGC 13条，总计57条
- 甘氨酸（Gly）tRNA：反密码子ACC 42条、CCC 10条、TCC 20条，总计72条
- 脯氨酸（Pro）tRNA：反密码子AGG 23条、CGG 10条、TGG 11条，总计44条
- 苏氨酸（Thr）tRNA：反密码子AGT 14条、CGT 13条、TGT 87条，总计114条
- 缬氨酸（Val）tRNA：反密码子AAC 24条、CAC 31条、TAC 6条，总计61条
- 丝氨酸（Ser）tRNA：反密码子AGA 23条、GGA 81条、CGA 15条、TGA 74条、GCT 88条，总计281条
- 精氨酸（Arg）tRNA：反密码子ACG 19条、CCG 9条、TCG 12条、CCT 8条、TCT 11条，总计59条
- 亮氨酸（Leu）tRNA：反密码子AAG 14条、GAG 14条、CAG 14条、TAG 11条、CAA 22条、TAA 8条，总计69条
- 苯丙氨酸（Phe）tRNA：反密码子GAA 38条，总计38条
- 天冬酰胺（Asn）tRNA：反密码子GTT 165条，总计165条
- 赖氨酸（Lys）tRNA：反密码子CTT 29条、TTT 18条，总计47条
- 天冬氨酸（Asp）tRNA：反密码子GTC 34条，总计34条
- 谷氨酸（Glu）tRNA：反密码子CTC 20条、TTC 16条，总计36条
- 组氨酸（His）tRNA：反密码子GTG 17条，总计17条
- 谷氨酰胺（Gln）tRNA：反密码子CTG 23条、TTG 10条，总计33条
- 异亮氨酸（Ile）tRNA：反密码子AAT 28条、TAT 17条，总计45条
- 起始甲硫氨酸/甲硫氨酸（iMet/Met）tRNA：反密码子CAT分别对应19条、18条，总计37条
- 酪氨酸（Tyr）tRNA：反密码子ATA 20条、GTA 20条，总计20条
- 抑制型tRNA（Supres）：反密码子TCA、CTA、TTA，总计0条
- 半胱氨酸（Cys）tRNA：反密码子GCA 76条，总计76条
- 色氨酸（Trp）tRNA：反密码子CCA 21条，总计21条
- 硒半胱氨酸tRNA（SelCys）：反密码子TCA，总计0条