Additional file 2 of Landscape and selection of vaccine epitopes in SARS-CoV-2

Additional file 2: Table S1. All SARS-CoV-2 MHC-I ligands contained in the top 5% of U.S. HLA alleles. Table S2. All SARS-CoV-2 MHC-II ligands contained in the top 5% of U.S. HLA alleles. Table S3. All SARS-CoV-2 MHC-I ligands contained in the top 5% of worldwide HLA alleles. Table S4. All SARS-CoV-2 MHC-II ligands contained in the top 5% of worldwide HLA alleles. Table S5. Summary of SARS-CoV-1 MHC ligands previously described in the literature. Table S6. SARS-CoV-2 B cell linear epitopes from array/mapping studies. Table S7. SARS-CoV-2 T cell epitopes within S, M, and N proteins. Table S8. SARS-CoV-2 T cell epitopes within all proteins. Table S9. Curated a dataset of published T cell epitope mapping studies.

附加文件2：表S1。收录于美国人群频率排名前5%的人类白细胞抗原（Human Leukocyte Antigen，HLA）等位基因中的所有新型冠状病毒（SARS-CoV-2）主要组织相容性复合体I类（Major Histocompatibility Complex class I，MHC-I）配体。表S2。收录于美国人群频率排名前5%的HLA等位基因中的所有新型冠状病毒MHC-II类（Major Histocompatibility Complex class II）配体。表S3。收录于全球人群频率排名前5%的HLA等位基因中的所有新型冠状病毒MHC-I类配体。表S4。收录于全球人群频率排名前5%的HLA等位基因中的所有新型冠状病毒MHC-II类配体。表S5。既往文献中已报道的所有严重急性呼吸综合征冠状病毒1（SARS-CoV-1）MHC配体汇总表。表S6。来源于芯片/表位定位研究的新型冠状病毒B细胞线性表位。表S7。新型冠状病毒刺突（S）、膜（M）及核衣壳（N）蛋白内部的T细胞表位。表S8。新型冠状病毒所有病毒蛋白内部的T细胞表位。表S9。经人工整理的已发表T细胞表位定位研究数据集。