arc18_site1
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Trajectories and data necessary to reproduce a simulation of compound ARC18 in the site 1in Developing Allosteric Inhibitors of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase byA. Chayka, M. Danda, A. Dostálková, V. Spiwok, A. Klimešová, M. Kapisheva, M. Zgarbová,J. Weber, T. Ruml, M. Rumlová and Z. Janeba (to be submited) forcefield - force filed parametersem - energy minimisationnvt - equilibration in the NVT ensembenpt1 - equilibration 1 in the NPT ensembenpt2 - equilibration 2 in the NPT ensembenpt3 - equilibration 3 in the NPT ensembenpt4 - equilibration 4 in the NPT ensembeprod - production trajectory
本数据集包含复现《SARS-CoV-2 RNA依赖的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase）变构抑制剂开发》研究中位点1处化合物ARC18模拟所需的轨迹与相关数据，作者为A. Chayka、M. Danda、A. Dostálková、V. Spiwok、A. Klimešová、M. Kapisheva、M. Zgarbová、J. Weber、T. Ruml、M. Rumlová及Z. Janeba（稿件待投）。 各模块说明如下： forcefield：力场参数 em：能量最小化（energy minimisation） nvt：NVT系综平衡 npt1：NPT系综平衡1 npt2：NPT系综平衡2 npt3：NPT系综平衡3 npt4：NPT系综平衡4 eprod：生产模拟轨迹
