Anas crecca nuDNA for IM.infile
收藏DataONE2012-06-21 更新2024-06-27 收录
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资源简介：
Input file for analysis of population history in the program IM. The input contains 8 loci sampled from 50 individuals of Anas crecca (25 from Eurasia, population 1; 25 from North America, population 2). Note that the data have been filtered for recombination, and therefore, some loci have fewer than 100 alleles sampled. The command line for running IM was: -i infile -q1 25 -m1 20 -m2 20 -t 1 -b 500000 -l 12.0 -a 50 -fg -g1 0.9 -g2 0.85 -k 30 -n 30 -q2 25 -qA 5 -s 105976 -p13 -j1 -e 24.0 -o outfile.txt
本文件为IM程序的种群历史分析输入文件。该输入包含从50个绿翅鸭（Anas crecca）个体中采集的8个基因座（locus）样本：其中种群1的25个个体采自欧亚大陆，种群2的25个个体采自北美大陆。请注意，该数据已针对重组进行了过滤，因此部分基因座的采样等位基因（allele）数量不足100个。运行IM程序的命令行参数如下：-i infile -q1 25 -m1 20 -m2 20 -t 1 -b 500000 -l 12.0 -a 50 -fg -g1 0.9 -g2 0.85 -k 30 -n 30 -q2 25 -qA 5 -s 105976 -p13 -j1 -e 24.0 -o outfile.txt
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2012-06-21
