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Overlap between module genes and established signatures.

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Figshare2015-12-02 更新2026-04-29 收录
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Modules 1-ER, 11-Prolif, 7-ERBB2 and 2-Dev/Basal share genes in common with the PAM50 gene set used to evaluate intrinsic subtype, the NKI70 prognostic classifer used in MammaPrint, or the 21-gene prognostic signature used in OncotypeDX. Immune modules 3–5, histone module 6-Hist, the stromal modules 8 and 9-ECM/Dev/Immune, and the ECM module 10-ECM have no genes in common with these signatures. Listed genes are present in both the specified module and the labeled signature. Genes in bold face are present in the module and multiple signatures.

模块1-ER、11-增殖(Prolif)、7-ERBB2以及2-发育/基底样(Dev/Basal)与用于评估固有亚型的PAM50基因集(PAM50 gene set)、MammaPrint检测中使用的NKI70预后分类器(NKI70 prognostic classifier),或是OncotypeDX所采用的21基因预后标志物(21-gene prognostic signature)存在共有基因。免疫模块3至5、组蛋白模块6-Hist、基质模块8与9-ECM/发育/免疫(ECM/Dev/Immune),以及细胞外基质(ECM)模块10-ECM则与上述标志物无共有基因。列表中所列基因同时存在于对应模块与标注的标志物中。以粗体标注的基因则同时存在于该模块与多种标志物中。
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2015-12-02
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