Data from 'Millimeter-sized Marine Plastics: A New Pelagic Habitat for Microorganisms and Invertebrates'

This fileset provides data and SEM images described in:

Reisser J, Shaw J, Hallegraeff G, Proietti M, Barnes DKA, Thums M, Wilcox C, Hardesty BD, Pattiaratchi (2014) Millimeter-sized Marine Plastics: A New Pelagic Habitat for Microorganisms and Invertebrates. PLOS ONE 

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Description of files

DataTable.xlsx --> contains information related to the collection sites, plastic characteristics, and organism/surface microtexture presence-absence data decribed in the PLOS ONE manuscript.

.tif files --> scanning electron microscopy images of marine plastic debris (N = 1143 images). The first number of the file name is the identification number of the plastic imaged (N = 68 pieces; see 1st column of DataTable.xls).

.txt files --> Polymer type as estimated by Perkin-Elmer ATR of Polymers Library (N = 66).

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Description of the variables/columns of DataTable.xlsx

# -> plastic identification number. Goes from 1 untill 68.

Type -> type of plastic. Hard (rigid fragment), Soft (flexible fragment), Pellet (raw material used to make plastic objects - see http://www.pelletwatch.org), Styro (expanded polystyrene/Styrofoam fragment).

Polymer -> polymer the plastic piece is made of. PE (polyethylene), PP (polypropylene), PS (polystyrene).

Length -> plastic length, in millimeters. Measured using ImageJ.

Solidity -> plastic solidity index. Measured using ImageJ.

Area -> plastic area, in squared millimeters. Measured using ImageJ.

Perimeter -> plastic perimeter, in millimeters. Measured using ImageJ.

Circularity -> plastic circularity index. Measured using ImageJ

AspectRatio -> plastic aspect ratio. Measured using ImageJ.

Roundness -> plastic roundness index. Measured using ImageJ.

LinearFracture -> presence/absence of linear fracture on the plastic. 1=present, 0=absent.

ConchoidalFracture -> presence/absence of conchoidal fracture on the plastic. 1=present, 0=absent.

Pit -> presence/absence of pit on the plastic. 1=present, 0=absent.

Groove -> presence/absence of groove on the plastic. 1=present, 0=absent.

Diatom -> presence/absence of diatom on the plastic. 1=present, 0=absent.

Coccolith -> presence/absence of coccolith on the plastic. 1=present, 0=absent.

Dinoflagellate -> presence/absence of dinoflagellate on the plastic. 1=present, 0=absent.

Round<1micron -> presence/absence of rounded cell smaller than 1 micrometer on the plastic. 1=present, 0=absent.

Round>=1micron -> presence/absence of rounded cell bigger than 1 micrometer on the plastic. 1=present, 0=absent.

Elong<1micron -> presence/absence of elongated cell smaller than 1 micrometer on the plastic. 1=present, 0=absent.

Elong>=1micron -> presence/absence of elongated cell bigger than 1 micrometer on the plastic. 1=present, 0=absent.

Spiral -> presence/absence of spiral cell on the plastic. 1=present, 0=absent.

Bryo -> presence/absence of bryozoan on the plastic. 1=present, 0=absent.

Lepas -> presence/absence of Lepas on the plastic. 1=present, 0=absent.

Isopod -> presence/absence of isopod on the plastic. 1=present, 0=absent.

Egg -> presence/absence of egg on the plastic. 1=present, 0=absent.

Worm -> presence/absence of worm on the plastic. 1=present, 0=absent.

Region -> marine region where the plastic was collected. North West, South West, South East, Temperate East, Coral Sea, and Pacific (see Figure 1 of the paper).

Date -> date (day.month.year) when the plastic was collected.

SeaTemperature -> Sea surface water temperature (in degrees celsius) of the plastic collection site.

Salinity -> Sea surface salinity of the plastic collection site.

Latitute -> latitude (in degrees) of the plastic collection site.

Longitude -> longitude (in degrees) of the plastic collection site.

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本数据集包含下述论文中提及的实验数据与扫描电子显微镜（Scanning Electron Microscopy, SEM）图像：
Reisser J, Shaw J, Hallegraeff G, Proietti M, Barnes DKA, Thums M, Wilcox C, Hardesty BD, Pattiaratchi (2014) 毫米级海洋塑料：一种可供微生物与无脊椎动物栖息的新型远洋生境. 《公共科学图书馆·综合》（PLOS ONE）
如有任何疑问或建议，请致邮[e-mail]与我们联系。

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文件说明
DataTable.xlsx：包含本论文手稿中提及的采样点位信息、塑料样品特性数据，以及生物/表面微结构的有无统计数据。

.tif文件：海洋塑料碎屑的扫描电子显微镜图像（共计1143张）。文件名首段数字为对应成像塑料样品的识别编号（共计68件；详见DataTable.xlsx的第一列）。

.txt文件：通过珀金埃尔默（Perkin-Elmer）衰减全反射（ATR）聚合物库鉴定得到的聚合物类型数据（共计66组）。

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DataTable.xlsx的变量/列项说明
#：塑料样品识别编号，取值范围为1至68。

Type：塑料样品类型，分为硬质（刚性碎屑）、软质（柔性碎屑）、粒料（制造塑料制品的原材料，详见http://www.pelletwatch.org）以及Styro（发泡聚苯乙烯/聚苯乙烯泡沫碎屑）。

Polymer：塑料样品的材质类型，涵盖PE（聚乙烯，Polyethylene）、PP（聚丙烯，Polypropylene）以及PS（聚苯乙烯，Polystyrene）。

Length：塑料样品的长度，单位为毫米，通过ImageJ软件测量得到。

Solidity：塑料样品的紧实度指数，通过ImageJ软件测量得到。

Area：塑料样品的面积，单位为平方毫米，通过ImageJ软件测量得到。

Perimeter：塑料样品的周长，单位为毫米，通过ImageJ软件测量得到。

Circularity：塑料样品的圆形度指数，通过ImageJ软件测量得到。

AspectRatio：塑料样品的长宽比，通过ImageJ软件测量得到。

Roundness：塑料样品的圆度指数，通过ImageJ软件测量得到。

LinearFracture：塑料样品表面线性裂纹的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

ConchoidalFracture：塑料样品表面贝壳状断口的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Pit：塑料样品表面凹坑的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Groove：塑料样品表面沟槽的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Diatom：塑料样品表面硅藻的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Coccolith：塑料样品表面球石粒的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Dinoflagellate：塑料样品表面双鞭毛虫的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Round<1micron：塑料样品表面尺寸小于1微米的圆形细胞的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Round>=1micron：塑料样品表面尺寸大于等于1微米的圆形细胞的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Elong<1micron：塑料样品表面尺寸小于1微米的长形细胞的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Elong>=1micron：塑料样品表面尺寸大于等于1微米的长形细胞的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Spiral：塑料样品表面螺旋形细胞的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Bryo：塑料样品表面苔藓虫的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Lepas：塑料样品表面茗荷（Lepas）的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Isopod：塑料样品表面等足类动物的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Egg：塑料样品表面卵类的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Worm：塑料样品表面蠕虫的有无情况，1代表存在，0代表不存在。

Region：塑料样品的采样海域，分为西北海域、西南海域、东南海域、温带东海域、珊瑚海以及太平洋（详见论文图1）。

Date：塑料样品的采样日期，格式为日.月.年。

SeaTemperature：塑料样品采样点的海表水温，单位为摄氏度。

Salinity：塑料样品采样点的海表盐度。

Latitude：塑料样品采样点的纬度，单位为度。

Longitude：塑料样品采样点的经度，单位为度。