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Multi-omics HUVEC data of Tibetan and Han in hypoxic induction.

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NIAID Data Ecosystem2026-03-12 收录
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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP250432
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资源简介:
Tibetan's adaptation to high-altitude environment at the Qinghai-Tibetan plateau represents a remarkable case of natural selection during recent human evolution. We generated time series paired RNAseq, ATACseq and Hi-C data in Tibetan and Han Chinese's umbilical endothelial cells from normoxia to hypoxia condition. Our results provide a broad resource of genome-wide hypoxia regulatory network to characterize the effect of genetic variation in high-altitude adaptation, and indicates large-scale maps of variants need proper cell types to understand its act on gene regulation. Overall design: Time series paired RNAseq, ATACseq and Hi-C data in Tibetan and Han Chinese's umbilical endothelial cells from normoxia to hypoxia condition.

藏族人群在青藏高原(Qinghai-Tibetan Plateau)对高海拔环境的适应,是近期人类演化历程中自然选择的标志性案例。我们在藏族与汉族的脐内皮细胞中,生成了从常氧到低氧条件下的时序配对RNA测序(RNAseq)、转座酶可及性测序(ATACseq)及高通量染色体构象捕获(Hi-C)数据。本研究结果为全基因组范围的低氧调控网络提供了丰富的研究资源,以解析遗传变异在高海拔适应中的功能效应;同时表明,大规模遗传变异图谱需要依托合适的细胞类型,才能阐明其对基因调控的作用机制。整体实验设计:在藏族与汉族的脐内皮细胞中,生成从常氧到低氧条件下的时序配对RNAseq、ATACseq及Hi-C数据。
创建时间:
2020-10-27
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