GammaProteo_Enterobacterales_Enterobacteriaceae.zip
收藏NIAID Data Ecosystem2026-03-12 收录
下载链接：
https://figshare.com/articles/dataset/GammaProteo_Enterobacterales_Enterobacteriaceae_zip/13043336
下载链接
链接失效反馈官方服务：
资源简介：
GeneHunt based identification of Glycoside Hydrolases in (completely) sequenced bacterial genomes - retrieved from PATRIC.brc.
Ref for GeneHunt: https://www.nature.com/articles/s41598-019-46290-w.
File types: SEQ_strain.txt :
Fasta formated AA sequence of identified GH in "strain"
STAT_stain.txt: Stat for all the Prot. Domain in GHs identified in "strain"
G0_strain.pdf: graphical representation of the GHs in the sequenced chromosome of "strain"
G1_strain.pdf: graphical representation of all the GHs in the sequenced chromosome of "strain"
基于GeneHunt工具对已（完全）测序细菌基因组中的糖苷水解酶（Glycoside Hydrolases）进行鉴定——数据集获取自PATRIC.brc数据库。
GeneHunt参考文献：https://www.nature.com/articles/s41598-019-46290-w。
文件类型说明：
SEQ_strain.txt：鉴定得到的目标菌株糖苷水解酶的FASTA格式氨基酸序列文件
STAT_stain.txt：该样本中鉴定得到的糖苷水解酶所含全部蛋白质结构域的统计文件
G0_strain.pdf：该目标菌株测序染色体上糖苷水解酶的可视化图谱文件
G1_strain.pdf：该目标菌株测序染色体上全部糖苷水解酶的可视化图谱文件
创建时间：
2020-10-02
