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GammaProteo_Enterobacterales_Enterobacteriaceae.zip

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NIAID Data Ecosystem2026-03-12 收录
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GeneHunt based identification of Glycoside Hydrolases in (completely) sequenced bacterial genomes - retrieved from PATRIC.brc. Ref for GeneHunt: https://www.nature.com/articles/s41598-019-46290-w. File types: SEQ_strain.txt : Fasta formated AA sequence of identified GH in "strain" STAT_stain.txt: Stat for all the Prot. Domain in GHs identified in "strain" G0_strain.pdf: graphical representation of the GHs in the sequenced chromosome of "strain" G1_strain.pdf: graphical representation of all the GHs in the sequenced chromosome of "strain"

基于GeneHunt工具对已(完全)测序细菌基因组中的糖苷水解酶(Glycoside Hydrolases)进行鉴定——数据集获取自PATRIC.brc数据库。 GeneHunt参考文献:https://www.nature.com/articles/s41598-019-46290-w。 文件类型说明: SEQ_strain.txt:鉴定得到的目标菌株糖苷水解酶的FASTA格式氨基酸序列文件 STAT_stain.txt:该样本中鉴定得到的糖苷水解酶所含全部蛋白质结构域的统计文件 G0_strain.pdf:该目标菌株测序染色体上糖苷水解酶的可视化图谱文件 G1_strain.pdf:该目标菌株测序染色体上全部糖苷水解酶的可视化图谱文件

创建时间:
2020-10-02
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