RCSB PDB 5GGS: PD-1 in complex with pembrolizumab Fab, 313K, 40°C, 500 ns: random seed #3: RMSD, SASA, RMSF, Rg, H-bonds

RCSB PDB 5GGS: PD-1 in complex with pembrolizumab Fab, 313K, 40°C, 500 ns: random seed #3. PDBs were obtained every 50 ns. RMSD, SASA, RMSF, Rg, H-bonds

RCSB蛋白质数据库（RCSB PDB）条目5GGS：记录了程序性死亡受体1（PD-1）与帕博利珠单抗Fab片段形成的复合物，模拟体系温度为313K（40℃），总模拟时长为500纳秒，模拟采用随机种子#3运行。该数据集每50纳秒采集一次PDB结构，包含的分析表征参数包括均方根偏差（RMSD）、溶剂可及表面积（SASA）、均方根涨落（RMSF）、回转半径（Rg）以及氢键（H-bonds）。