CIRCpedia

CIRCpedia v3 is a comprehensively upgraded circular RNA research platform integrating 2,350 NGS and 63 TGS datasets spanning 20 species. It systematically annotates 2.6 million circular RNAs with conservation insights, cognate linear RNA expression profiles, and degradation dynamics. The update introduces four innovative modules: gene editing validation, therapeutic circRNA optimization, subcellular localization prediction, and multi-molecular interaction analysis. An enhanced interactive visualization suite enables dynamic data filtering, cross-dataset comparison, and real-time analytics.

CIRCpedia v3是一款全面升级的环状RNA（circular RNA, circRNA）研究平台，整合了覆盖20个物种的2350套下一代测序（Next Generation Sequencing, NGS）数据集与63套三代测序（Third Generation Sequencing, TGS）数据集。该平台对260万条环状RNA完成了系统性注释，涵盖进化保守性特征、同源线性RNA表达谱以及降解动态特征等核心信息。本次更新新增四大创新模块：基因编辑验证、治疗性环状RNA优化、亚细胞定位预测及多分子相互作用分析。此外，升级后的交互式可视化套件支持动态数据筛选、跨数据集对比与实时分析功能。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CIRCpedia v3是一个综合性环状RNA研究平台，整合了2,350个NGS和63个TGS数据集，覆盖20个物种，系统注释了260万个环状RNA，并提供多种创新分析模块。该平台具有大规模数据整合和多功能分析的特点，适用于环状RNA的深入研究。