embryo A-class motor neurons tiling array

modENCODE_submission_654 This submission comes from a modENCODE project of Robert Waterston. For full list of modENCODE projects, see http://www.genome.gov/26524648 Project Goal: Our experiments are designed to detect all C. elegans transcripts by hybridizing RNA to commerically available genome tiling arrays. To maximize the chances of detecting rare transcripts with limited expression in specific cells, we are extracting RNA from selected embryonic cells isolated by FACS and from postembryonic cells by use of the mRNA tagging method. For data usage terms and conditions, please refer to http://www.genome.gov/27528022 and http://www.genome.gov/Pages/Research/ENCODE/ENCODEDataReleasePolicyFinal2008.pdf Keywords: Transcript tiling array analysis EXPERIMENT TYPE: Transcript tiling array analysis. BIOLOGICAL SOURCE: Strain: NC300 (engineered, target gene unc-119 tagged by GFP); Tissue: unc-4 neurons (embryonic); Developmental Stage: Mixed stage of embryos 20dC; Genotype: wdIs5[unc-4::GFP; dpy-20(e1282)]; Sex: Hermaphrodite; NUMBER OF REPLICATES: 3; EXPERIMENTAL FACTORS: Strain NC300 (engineered, target gene unc-119 tagged by GFP); temperature 20; Developmental Stage Mixed stage of embryos 20dC; Tissue unc-4 neurons (embryonic)

modENCODE_submission_654 本提交源自Robert Waterston的modENCODE项目。如需查看modENCODE项目的完整列表，请访问http://www.genome.gov/26524648。
项目目标：本实验旨在通过将RNA与商用基因组平铺阵列（genome tiling arrays）杂交，检测秀丽隐杆线虫（C. elegans）的全部转录本。为提升检测特定细胞中低表达稀有转录本的概率，本实验团队分别从经荧光激活细胞分选（Fluorescence-Activated Cell Sorting, FACS）分离的胚胎细胞，以及采用mRNA标记技术（mRNA tagging method）获取的胚后细胞中提取RNA。
关于本数据集的使用条款与条件，请参阅http://www.genome.gov/27528022 及http://www.genome.gov/Pages/Research/ENCODE/ENCODEDataReleasePolicyFinal2008.pdf。
关键词：转录本平铺阵列分析（Transcript tiling array analysis）
实验类型：转录本平铺阵列分析（Transcript tiling array analysis）
生物来源：
菌株：NC300（工程化菌株，靶基因unc-119经绿色荧光蛋白（GFP）标记）；
组织：unc-4神经元（胚胎来源）；
发育阶段：20℃培养条件下的混合期胚胎；
基因型：wdIs5[unc-4::GFP; dpy-20(e1282)]；
性别：雌雄同体（Hermaphrodite）；
生物学重复次数：3次；
实验因素：
菌株NC300（工程化菌株，靶基因unc-119经绿色荧光蛋白（GFP）标记）；
培养温度：20℃；
发育阶段：20℃培养条件下的混合期胚胎；
组织：unc-4神经元（胚胎来源）