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CardioAtlas

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国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-08-23 收录
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http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CardioAtlas
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官方服务:
资源简介:
CardioAtlas is a comprehensive scRNA-seq data resource and analysis platform that aggregates >3 016 000 cells across 27 human and 39 mouse cardiovascular datasets into 12 and 15 reference atlases (43 human and 39 mouse cell types), and provides five interactive modules—cell-type prediction, marker-gene identification, functional enrichment, regulon analysis, and cell-cell communication—plus upload-and-analyse functionality.

心脏图谱(CardioAtlas)是一款综合性单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)数据资源与分析平台。该平台整合了来自27个人类与39个小鼠心血管数据集的超301.6万个细胞,构建出12个人类参考图谱与15个小鼠参考图谱,涵盖43种人类细胞类型及39种小鼠细胞类型;平台提供五大交互式分析模块,分别为细胞类型预测、标记基因识别、功能富集分析、调控子分析以及细胞间通讯分析,同时附带上传与分析功能。
提供机构:
Harbin Medical University
创建时间:
2025-07-01
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
CardioAtlas是一个综合性的心血管疾病单细胞转录组资源库,包含27个人类和39个小鼠单细胞RNA测序项目,分别涵盖约192.9万和108.8万个细胞。该数据库提供了6大分析模块,支持用户交互式探索心血管组织和疾病中的细胞类型注释及功能分析。
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