HCP-MMP 1.0 projected on 7T MRI data (59k mesh)

Hello everyone,In order to resample the HCP-MMP1.0 parcellation, following steps were done and the new mesh is attached here.1. download needed materials followed by suggestion below:https://www.mail-archive.com/[e-mail]/msg06289.htmlThey are:1.1 original mesh( Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.32k_fs_LR.dlabel.nii) from BALSA: https://balsa.wustl.edu/WN561.2 download group standard 32K and 59K spheres for both hemispheres (Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.sphere.32k_fs_LR.surf.gii; Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.sphere.32k_fs_LR.surf.gii, L.sphere.59k_fs_LR.surf.gii & R.sphere.59k_fs_LR.surf.gii) from HCP Github: https://github.com/Washington-University/HCPpipelines/tree/master/global/templates/standard_mesh_atlases 2. using workbench, separate, resample and merge parcellation files:wb_command -cifti-separate Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.32k_fs_LR.dlabel.nii COLUMN -label CORTEX_LEFT Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.32k_fs_LR.dlabel.giiwb_command -cifti-separate Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.32k_fs_LR.dlabel.nii COLUMN -label CORTEX_RIGHT Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.32k_fs_LR.dlabel.giiwb_command -label-resample Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.32k_fs_LR.dlabel.gii Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.sphere.32k_fs_LR.surf.gii L.sphere.59k_fs_LR.surf.gii BARYCENTRIC Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.59k_fs_LR.dlabel.niiwb_command -label-resample Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.32k_fs_LR.dlabel.gii Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.sphere.32k_fs_LR.surf.gii R.sphere.59k_fs_LR.surf.gii BARYCENTRIC Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.59k_fs_LR.dlabel.niiwb_command -cifti-create-label Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.59k_fs_LR.dlabel.nii -left-label Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.59k_fs_LR.dlabel.nii -right-label Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.59k_fs_LR.dlabel.niiNOTE: when doing merge, there's error for label-merge function for dlabel.nii file, therefore I changed the code to -cifti-create-label followed the suggestion from:https://www.mail-archive.com/[e-mail]/msg03217.html3.Pick up the new mesh: Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.59k_fs_LR.dlabel.nii4. Enjoy :)AcknowledgementThanks for the help of my supervisor Michelle Moerel during this transformation. Wish her all the best~

各位同仁：为完成人类连接组项目多模态脑区分割1.0（HCP-MMP1.0）的重采样工作，我们按照如下流程完成操作，新的网格文件已随附于此。
1. 按照以下建议下载所需材料：https://www.mail-archive.com/[e-mail]/msg06289.html，所需材料包括：
1.1 来自脑注释与标记共享应用平台（BALSA）的原始网格文件：Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.32k_fs_LR.dlabel.nii，下载链接：https://balsa.wustl.edu/WN56
1.2 从华盛顿大学HCP管线GitHub仓库下载双侧半球的32K与59K分辨率组水平标准球面网格：Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.sphere.32k_fs_LR.surf.gii、Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.sphere.32k_fs_LR.surf.gii、L.sphere.59k_fs_LR.surf.gii及R.sphere.59k_fs_LR.surf.gii，仓库地址：https://github.com/Washington-University/HCPpipelines/tree/master/global/templates/standard_mesh_atlases
2. 使用连接组工作台（Workbench）工具完成分割文件的分离、重采样与合并操作，具体命令如下：
wb_command -cifti-separate Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.32k_fs_LR.dlabel.nii COLUMN -label CORTEX_LEFT Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.32k_fs_LR.dlabel.gii
wb_command -cifti-separate Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.32k_fs_LR.dlabel.nii COLUMN -label CORTEX_RIGHT Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.32k_fs_LR.dlabel.gii
wb_command -label-resample Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.32k_fs_LR.dlabel.gii Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.sphere.32k_fs_LR.surf.gii L.sphere.59k_fs_LR.surf.gii BARYCENTRIC Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.59k_fs_LR.dlabel.nii
wb_command -label-resample Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.32k_fs_LR.dlabel.gii Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.sphere.32k_fs_LR.surf.gii R.sphere.59k_fs_LR.surf.gii BARYCENTRIC Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.59k_fs_LR.dlabel.nii
wb_command -cifti-create-label Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.59k_fs_LR.dlabel.nii -left-label Q1-Q6_RelatedParcellation210.L.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.59k_fs_LR.dlabel.nii -right-label Q1-Q6_RelatedParcellation210.R.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group.59k_fs_LR.dlabel.nii
注意：在合并步骤中，原dlabel.nii文件的标签合并函数出现报错，因此我们参考https://www.mail-archive.com/[e-mail]/msg03217.html中的建议，改用-cifti-create-label命令完成合并。
3. 获取最终新网格文件：Q1-Q6_RelatedParcellation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.59k_fs_LR.dlabel.nii
4. 请按需使用~
致谢：感谢我的导师Michelle Moerel在本次转换工作中提供的帮助，祝她一切顺利。