Rola kondensatów białka polimerazy II ekspresji genów podczas rozwoju embrionalnego

Na podstawie naszych wstępnych obserwacji, które wykazały, że podczas rozwoju Caenorhabditis elegans polimeraza II RNA (RNAPII) tworzy kondensaty w jądrach komórek zarodkowych, postawiliśmy hipotezę, że struktury te mogą odgrywać istotną rolę w regulacji transkrypcji we wczesnym rozwoju embrionalnym. W celu jej weryfikacji przeprowadziliśmy szczegółowe badania zachowania RNAPII w embrionach szczepu C. elegans posiadającego fluorescencyjnie znakowaną największą podjednostkę RNAPII, AMA-1.Nasze badania obejmowały trzy główne zadania. Po pierwsze, dokonaliśmy ilościowej i jakościowej oceny wybranych parametrów kondensatów RNAPII, takich jak ich liczba, wielkość, dynamika oraz lokalizacja w jądrze komórkowym, z wykorzystaniem mikroskopii superrozdzielczej vt-iSIM. Po drugie, analizowaliśmy proces powstawania i/lub rozpadu kondensatów RNAPII w warunkach zaburzeń środowiskowych (np. szoku cieplnego) oraz genetycznych (z zastosowaniem interferencji RNA), aby określić czynniki wpływające na ich stabilność i organizację. Po trzecie, zbadaliśmy wpływ zakłóceń w tworzeniu kondensatów RNAPII na poziom ekspresji genów (RNA-seq), co pozwoliło ocenić ich funkcjonalne znaczenie.Zbiór danych obejmuje obrazy mikroskopii fluorescencyjnej oraz wyniki analiz ilościowych uzyskanych z embrionów C. elegans, zapisane w formacie plików .xlsx. Podsumowanie wyników przedstawiono w formie prezentacji zapisanej w pliku .pdf. Uzyskane wyniki dostarczają nowych informacji na temat roli kondensatów RNAPII w regulacji procesów transkrypcyjnych podczas wczesnych etapów rozwoju embrionalnego.

基于我们的初步观察结果——该观察证实，在秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）的发育过程中，RNA聚合酶II（RNAPII）会在胚胎细胞核内形成凝聚体——我们提出假说：这类结构可能在胚胎早期发育的转录调控中发挥重要作用。为验证该假说，我们针对携带荧光标记的RNAPII最大亚基AMA-1的秀丽隐杆线虫品系胚胎，开展了关于RNAPII行为的详细研究。本研究包含三项核心任务：首先，借助超分辨显微镜vt-iSIM，对RNAPII凝聚体的多项关键参数（包括数量、尺寸、动态特性及细胞核内定位）进行定量与定性评估；其次，分析环境扰动（如热休克）及遗传扰动（采用RNA干扰技术）条件下RNAPII凝聚体的形成与/或解离过程，以此明确影响其稳定性与组装的调控因子；最后，通过RNA测序（RNA-seq）技术，探究RNAPII凝聚体形成受阻对基因表达水平的影响，从而评估这类结构的功能意义。本数据集包含从秀丽隐杆线虫胚胎获取的荧光显微镜图像及定量分析结果，以.xlsx文件格式存储；研究结果的总结以.pdf格式的演示文稿呈现。本研究所得结果为阐明RNAPII凝聚体在胚胎早期发育阶段转录调控过程中的作用提供了新的认知。