How C/EBPa creates an elite cell state for reprogramming to pluripotency [ATACseq]
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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP061427
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资源简介：
Mouse Bcell, upon ectopic expression of the transcription factor Cebpa for 18h, can be reprogrammed to iPS with extremely high efficiency. To understand the molecular control of this phenomena we performed multiple high throughtput functionnal genomic analysis. Overall design: Chromatin accessibility by ATACseq in Bcell, Bcell+Cebpa18h, Bcell+Cebpa18h+OKSM1d, Bcell+Cebpa18h+OKSM2d, ES cells
将转录因子Cebpa异位表达18小时后，小鼠B细胞可被极高效率地重编程为诱导多能干细胞（iPS）。为解析该现象的分子调控机制，我们开展了多组高通量功能基因组学分析。整体实验设计：通过转座酶可及性测序（ATAC-seq）检测以下样本的染色质可及性：B细胞、异位表达Cebpa 18小时的B细胞、异位表达Cebpa 18小时并联合OKSM培养1天的B细胞、异位表达Cebpa 18小时并联合OKSM培养2天的B细胞，以及胚胎干细胞（ES细胞）
创建时间：
2018-04-28
