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Ortholog hit ratio of transcripts with ORF comparing to zebrafish protein database.

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Figshare2016-02-23 更新2026-04-29 收录
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(A) ortholog hit ratio against target protein length, showing the relationship of the completeness of transcripts with lengths. (B) Ortholog hit ratio distribution for all transcripts with ORF. A ratio of 1 means the transcript thoroughly covers the target in zebrafish protein database, and a value larger than 1 implies a possible gene extension.

(A) 针对目标蛋白长度的直系同源匹配率(ortholog hit ratio),用于展示转录本完整性与其长度之间的相关性。(B) 所有携带开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)的转录本的直系同源匹配率分布情况:当匹配率为1时,代表该转录本可在斑马鱼蛋白数据库中完全覆盖目标蛋白;若匹配率大于1,则暗示该转录本存在基因延伸的可能性。
创建时间:
2016-02-23
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