five

fls2 cds MUSCLE aligned

收藏
NIAID Data Ecosystem2026-03-13 收录
下载链接:
https://figshare.com/articles/dataset/fls2_cds_MUSCLE_aligned/19365491
下载链接
链接失效反馈
官方服务:
资源简介:
Coding sequences of fls2 genes, aligned as translated amino acids using MUSCLE in Aliview. The sequences include Solanum lycopersicum, Nicotiana attenuata, Capsicum annuum, Capsicum annuum, Capsicum annuum, Solanum tuberosum, Oryza sativa Japonica group, Hordeum vulgare, Phaseolus vulgaris, Zea mays, Triticum aestivum, Ananas comosus, and Arabidopsis thaliana. Sequences were obtained from Ensembl Plants using a TBLASTN search. The reference sequence used was "Solanum_lycopersicum_MH079061.1", obtained from NCBI.

本数据集收录了fls2基因的编码序列,所有序列已通过Aliview软件中的MUSCLE算法,以翻译得到的氨基酸序列为参考完成多重序列比对。所涉及的物种包括番茄(Solanum lycopersicum)、渐狭烟草(Nicotiana attenuata)、辣椒(Capsicum annuum)、辣椒(Capsicum annuum)、辣椒(Capsicum annuum)、马铃薯(Solanum tuberosum)、粳稻(Oryza sativa Japonica group)、大麦(Hordeum vulgare)、菜豆(Phaseolus vulgaris)、玉米(Zea mays)、普通小麦(Triticum aestivum)、菠萝(Ananas comosus)以及拟南芥(Arabidopsis thaliana)。所有序列均通过TBLASTN搜索从Ensembl植物数据库(Ensembl Plants)中获取。本研究所用的参考序列为取自NCBI的"Solanum_lycopersicum_MH079061.1"。
创建时间:
2022-03-16
5,000+
优质数据集
54 个
任务类型
进入经典数据集
二维码
社区交流群

面向社区/商业的数据集话题

二维码
科研交流群

面向高校/科研机构的开源数据集话题

数据驱动未来

携手共赢发展

商业合作