MethMarkerDB: a comprehensive cancer DNA methylation biomarker database

MethMarkerDB is a comprehensive cancer DNA methylation biomarker database based on WGBS data, providing precise genomic location information for biomarkers, including genes and DMRs. It offers various functions such as literature-based marker gene search, pan-cancer biomarker search, and diagnostic/prognostic tools, supporting the discovery and clinical application of novel DNA methylation biomarkers in cancer.

MethMarkerDB是一款基于全基因组亚硫酸氢盐测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS）数据构建的综合性癌症DNA甲基化生物标志物数据库，可为涵盖基因与差异甲基化区域（Differentially Methylated Regions, DMRs）在内的各类生物标志物提供精准的基因组定位信息。该数据库提供多项功能，包括基于文献的标志物基因检索、泛癌症生物标志物检索以及诊断/预后分析工具，可支撑癌症领域新型DNA甲基化生物标志物的发现与临床应用。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

MethMarkerDB是一个基于全基因组DNA甲基化测序（WGBS）数据的综合癌症DNA甲基化生物标志物数据库，整合了724个生物标志物基因和1425篇相关文献。它提供生物标志物基因搜索、区域搜索、泛癌DMR分析以及诊断和预后评估功能，支持癌症DNA甲基化生物标志物的发现和临床应用。