从江香猪生长繁殖性状与基因组甲基化关联分析数据集
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资源简介:
数据清洗与校验规则:对所有纳入数据集的表型数据、甲基化检测数据进行全维度有效性校验,剔除样本信息缺失、检测质控不合格、表型数据异常的无效数据,确保所有数据均来自合规设计的试验、权威检测机构,数据真实可追溯;统一数据单位、指标命名规范、数据格式,修正数据格式错误,确保全库数据的一致性与可比性。 数据加工与结构化处理规则:按 “样本信息 - 表型性状 - 甲基化检测 - 关联分析 - 基因注释” 的逻辑进行五级分层拆解,为每条数据配套多维度核心标签,实现数据的快速检索、精准筛选与关联分析;将表型性状数据与甲基化位点、功能基因进行全链路关联绑定,建立 “性状 - 位点 - 基因” 的一一对应关系,实现数据全流程可追溯、可分析。 算法与模型应用:采用全基因组甲基化关联分析(EWAS)算法,定位与从江香猪生长繁殖性状显著关联的甲基化位点;结合 GO/KEGG 富集分析算法,完成候选功能基因的注释与功能富集;采用机器学习算法,构建基于甲基化标记的性状预测模型,实现生长繁殖性状的早期预判,提升育种效率。 合规处理:本数据集所有数据均为合规试验产生的实测数据,数据来源合法合规,所有试验均符合动物伦理相
提供机构:
陈彬创建时间:
2026-06-11
搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集聚焦从江香猪的生长繁殖性状,整合表型数据与全基因组甲基化检测结果,通过EWAS算法定位与性状显著关联的甲基化位点,并结合GO/KEGG富集分析和机器学习模型,构建了“性状-位点-基因”的关联体系,为地方猪种的良种选育、遗传资源保护及性状早期预测提供数据支撑。
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