E. coli carrying blaCTX-M group 1 genes with their corresponding plasmids and resistance profile.

1The following deviations were found in IncI1 pMLST types: ESBL-0062: trbA8#: nucleotide 371 T>C; ESBL-0441: ardA5*: 59 G>A, 137 A>T, 271 C>G, 331 C>T; ESBL-0450: ardA5?: 199 G>A, 271 C>G, 331 C>T; ESBL-0477: ardA9#: 199 G>A/C2The following deviations were found in IncF RST types: ESBL-0301: FIB-26#: 251 G>T; ESBL-0382: FII-13#: 77 A>G and FIB-20#: 194 G>A, 203 T>C; ESBL-0519/0565/0567: FII-35#: 22 A>T, 38+39>CG insertion.3Amp = ampicillin, Ctx = cefotaxime, Caz = ceftazidime, Nal = nalidixic acid, Cip = ciprofloxacin, Ffn = florfenicol, Chl = chloramphenicol, Tet = tetracycline, Smx = sulfamethoxazole, Tmp = trimethoprim, Str = streptomycin, Kan = kanamycin, Gen = gentamicin), Col = colistin.4qnrS and aac(6′)Ib-cr are not ß-lactamase genes, but cause reduced susceptibility to quinolones. aac(6′)Ib-cr also causes reduced susceptibility to aminoglycosides.5Plasmid size in kilo bases (kb) of non-typeble plasmids.

1. 针对IncI1型质粒多位点序列分型（IncI1 pMLST），检出以下变异类型：超广谱β-内酰胺酶（Extended-spectrum β-lactamase，ESBL）菌株ESBL-0062：trbA8#：核苷酸371位点T>C；ESBL-0441：ardA5*：59位G>A、137位A>T、271位C>G、331位C>T；ESBL-0450：ardA5?：199位G>A、271位C>G、331位C>T；ESBL-0477：ardA9#：199位G>A/C。
2. 针对IncF型质粒重复序列分型（IncF RST），检出以下变异类型：ESBL-0301：FIB-26#：251位G>T；ESBL-0382：FII-13#：77位A>G，同时FIB-20#：194位G>A、203位T>C；ESBL-0519/0565/0567：FII-35#：22位A>T，38位与39位之间插入CG序列。
3. 本部分为抗生素缩写对照表：Amp=氨苄西林（ampicillin），Ctx=头孢噻肟（cefotaxime），Caz=头孢他啶（ceftazidime），Nal=萘啶酸（nalidixic acid），Cip=环丙沙星（ciprofloxacin），Ffn=氟苯尼考（florfenicol），Chl=氯霉素（chloramphenicol），Tet=四环素（tetracycline），Smx=磺胺甲噁唑（sulfamethoxazole），Tmp=甲氧苄啶（trimethoprim），Str=链霉素（streptomycin），Kan=卡那霉素（kanamycin），Gen=庆大霉素（gentamicin），Col=粘菌素（colistin）。
4. qnrS与aac(6′)-Ib-cr不属于β-内酰胺酶基因，但可降低菌株对喹诺酮类药物的敏感性；其中aac(6′)-Ib-cr还可降低菌株对氨基糖苷类药物的敏感性。
5. 不可分型质粒的质粒大小以千碱基对（kb）为单位标注。