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Pennisetum flaccidum Genome sequencing and assembly

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NIAID Data Ecosystem2026-03-12 收录
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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP300028
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Pennisetum flaccidum Grisebach is a typical high-quality forage and drought-tolerant grass. In the present study, we firstly reported the complete chloroplast genome of P. flaccidum, which was 138,336 bp in length, including a pair of inverted repeats (IR:22,293 bp), a large single copy (LSC: 81,328 bp), and a small single copy (SSC: 12,422 bp) region. 131 genes were annotated, containing 7 rRNA genes, 37 tRNA genes, and 87 protein-coding genes. The GC content of the chloroplast genome was 45.86%. The Maximum likelihood phylogenetic tree indicated that P. flaccidum may be closely related to Setaria within the family of Poaceae.

白草(Pennisetum flaccidum Grisebach)是一种典型的优质饲用牧草与耐旱草本植物。本研究首次报道了白草的完整叶绿体基因组,其全长为138336 bp,包含一对反向重复序列(IR:22293 bp)、一个大单拷贝区(LSC:81328 bp)与一个小单拷贝区(SSC:12422 bp)。该基因组共注释得到131个基因,其中包括7个核糖体RNA(rRNA)基因、37个转运RNA(tRNA)基因以及87个蛋白编码基因。其叶绿体基因组的GC含量为45.86%。最大似然系统发育树分析结果显示,白草隶属于禾本科(Poaceae),且与狗尾草属(Setaria)植物亲缘关系较近。
创建时间:
2021-01-13
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