SeqLengthPlot assessment on the de novo paired-end transcriptome assembly of Savalia savaglia

This dataset contains the output folder compiled by SeqLengthPlot assessed on the de novo paired-end transcriptome assembly of the false black coral Savalia savaglia.

The folder seq_length_Assembly_Ss_PE.Trinity contains:

• seq_above199bp.fasta: Retrieved FASTA file containing transcripts with lengths of 200 bp and above, after splitting of the input FASTA file.

• seq_below200bp.fasta: Retrieved FASTA file containing transcripts with lengths below 200 bp, after splitting of the input FASTA file.

• seq_length_distribution_above99bp.png: PNG image file showing a histogram of transcripts with lengths of 200 bp and above on a linear scale.

• seq_length_distribution_above199_log.png: PNG image file showing a histogram of transcripts with lengths of 200 bp and above on a logarithmic scale.

• seq_length_distribution_below200bp.png: PNG image file showing a histogram of transcripts with lengths below 200 bp on a linear scale.

• seq_length_distribution_below200_log.png: PNG image file showing a histogram of transcripts with lengths below 200 bp on a logarithmic scale.

• seq_length_stats_by_threshold_200.txt: Text file containing detailed statistics of the transcripts lengths in the input FASTA file, including the total number of sequences, the number of sequences 200 bp and above, the number of sequences below 200 bp, and the corresponding minimum and maximum lengths.

本数据集包含由SeqLengthPlot针对假黑珊瑚*Savalia savaglia*的从头配对末端转录组组装结果进行评估后生成的输出文件夹。
名为seq_length_Assembly_Ss_PE.Trinity的文件夹内包含以下内容：
• seq_above199bp.fasta：经拆分输入FASTA文件后得到的FASTA格式文件，其中收录了长度不低于200 bp的转录本序列。
• seq_below200bp.fasta：经拆分输入FASTA文件后得到的FASTA格式文件，其中收录了长度低于200 bp的转录本序列。
• seq_length_distribution_above99bp.png：PNG格式图像文件，以线性刻度展示长度不低于200 bp的转录本序列长度分布直方图。
• seq_length_distribution_above199_log.png：PNG格式图像文件，以对数刻度展示长度不低于200 bp的转录本序列长度分布直方图。
• seq_length_distribution_below200bp.png：PNG格式图像文件，以线性刻度展示长度低于200 bp的转录本序列长度分布直方图。
• seq_length_distribution_below200_log.png：PNG格式图像文件，以对数刻度展示长度低于200 bp的转录本序列长度分布直方图。
• seq_length_stats_by_threshold_200.txt：文本格式文件，包含输入FASTA文件中转录本长度的详细统计信息，具体包括序列总数量、长度不低于200 bp的序列数量、长度低于200 bp的序列数量，以及对应的最小、最大序列长度。