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final_soap_Callid

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DataONE2014-06-05 更新2024-06-27 收录
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final_soap_Callid.fa: Assembly of Pterodecta felderi from Genbank SRA accession #SRR1299369, using multiple kmers (13,23,33,43,63) with SOAPdenovo-Trans v1.01. Different Kmer assemblies were combined with cd-hit-est and processed with the fastx toolkit. See Kawahara and Breinholt (2014) for more details.

final_soap_Callid.fa:本数据集为依托基因银行(GenBank)序列读取档案(Sequence Read Archive, SRA)登录号SRR1299369的测序数据,组装费氏翼螨(Pterodecta felderi)转录组的成果。本次组装采用SOAPdenovo-Trans v1.01软件,使用多组Kmer值(13、23、33、43、63)完成运算;随后通过cd-hit-est软件合并不同Kmer值组装得到的结果,并借助fastx工具包(FASTX Toolkit)开展后续处理。更多细节可参考Kawahara与Breinholt(2014)的相关研究。
创建时间:
2014-06-05
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