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Data from: New resources for genetic studies in Populus nigra: genome wide SNP discovery and development of a 12k Infinium array|基因组学数据集|遗传研究数据集
收藏DataONE2016-01-29 更新2024-06-27 收录
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Whole genome resequencing of 51 Populus nigra (L.) individuals from across Western Europe was performed using Illumina platforms. A total number of 1,878,727 SNPs distributed along the P. nigra reference sequence were identified. The SNP calling accuracy was validated with Sanger sequencing. SNPs were selected within 14 previously identified QTL regions; 2916 expressional candidate genes related to rust resistance, wood properties, water-use efficiency and bud phenology and 1732 genes randomly spread across the genome. Over 10,000 SNPs were selected for the construction of a 12k Infinium BeadChip array dedicated to association mapping. The SNP genotyping assay was performed with 888 P. nigra individuals. The genotyping success rate was 91%. Our high success rate was due to the discovery panel design and the stringent parameters applied for SNP calling and selection. In the same set of P. nigra genotypes, linkage disequilibrium throughout the genome decayed on average within 5 to 7 kb to half of its maximum value. As an application test, ADMIXTURE analysis was performed with a selection of 600 SNPs spread throughout the genome and 706 individuals collected along 12 river basins. The admixture pattern was consistent with genetic diversity revealed by neutral markers and the geographical distribution of the populations. These newly developed SNP resources and genotyping array provide a valuable tool for population genetic studies and identification of QTLs through natural-population based genetic association studies in P. nigra.
创建时间：
2016-01-29
数据主题
5,000+
优质数据集
54 个
任务类型
进入经典数据集
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RAVDESS
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OpenDataLab 收录
HazyDet
HazyDet是由解放军工程大学等机构创建的一个大规模数据集，专门用于雾霾场景下的无人机视角物体检测。该数据集包含383,000个真实世界实例，收集自自然雾霾环境和正常场景中人工添加的雾霾效果，以模拟恶劣天气条件。数据集的创建过程结合了深度估计和大气散射模型，确保了数据的真实性和多样性。HazyDet主要应用于无人机在恶劣天气条件下的物体检测，旨在提高无人机在复杂环境中的感知能力。
arXiv 收录
中国食物成分数据库
食物成分数据比较准确而详细地描述农作物、水产类、畜禽肉类等人类赖以生存的基本食物的品质和营养成分含量。它是一个重要的我国公共卫生数据和营养信息资源，是提供人类基本需求和基本社会保障的先决条件；也是一个国家制定相关法规标准、实施有关营养政策、开展食品贸易和进行营养健康教育的基础，兼具学术、经济、社会等多种价值。 本数据集收录了基于2002年食物成分表的1506条食物的31项营养成分（含胆固醇）数据，657条食物的18种氨基酸数据、441条食物的32种脂肪酸数据、130条食物的碘数据、114条食物的大豆异黄酮数据。
国家人口健康科学数据中心 收录
Materials Project
材料项目是一组标有不同属性的化合物。数据集链接： MP 2018.6.1（69,239 个材料） MP 2019.4.1（133,420 个材料）
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PDT Dataset
PDT数据集是由山东计算机科学中心（国家超级计算济南中心）和齐鲁工业大学（山东省科学院）联合开发的无人机目标检测数据集，专门用于检测树木病虫害。该数据集包含高分辨率和低分辨率两种版本，共计5775张图像，涵盖了健康和受病虫害影响的松树图像。数据集的创建过程包括实地采集、数据预处理和人工标注，旨在为无人机在农业中的精准喷洒提供高精度的目标检测支持。PDT数据集的应用领域主要集中在农业无人机技术，旨在提高无人机在植物保护中的目标识别精度，解决传统检测模型在实际应用中的不足。
arXiv 收录