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filter_fasta.py

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DataONE2016-01-21 更新2024-06-27 收录
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Usage: ./filter_fasta.py [path to input dir] [path to accepted taxon list]. Input files are expected to be in fasta format. The script will traverse all files in the input dir, so the input dir should contain only fasta files. The taxon list should be a line-delimited text file containing the names of tips as they correspond to those in the fasta alignments.

使用方式:./filter_fasta.py [输入目录路径] [可接受分类单元列表路径]。输入文件需为FASTA格式。本脚本将遍历输入目录下的所有文件,因此输入目录仅可包含FASTA格式文件。分类单元列表应为按行分隔的文本文件,其中各行内容为与FASTA比对序列相对应的分类单元名称。
创建时间:
2016-01-21
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