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DataCite Commons2023-01-23 更新2024-07-13 收录
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Full list of differentially expressed genes (DEGs) in Coffea arabica cv. Icatu (Icatu) found between severe water deficit (SWD) vs. well-watered (WW) plants. Gene identification and protein name according to Coffea canephora functional annotation retrieved from the Coffee Genome Hub (http://coffee-genome.org: 4 January 2020). DEGs were selected with DESeq2 and filtered by log2 fold change (FC) 6= 0 and false discovery rate (FDR) 0.01.

本数据集涵盖阿拉比卡咖啡(Coffea arabica)品种伊卡图(Icatu)在严重水分亏缺(severe water deficit, SWD)与充分供水(well-watered, WW)植株间的全部差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)列表。基因鉴定与蛋白命名依据2020年1月4日从咖啡基因组数据库(Coffee Genome Hub,http://coffee-genome.org)获取的刚果咖啡(Coffea canephora)功能注释信息完成。差异表达基因通过DESeq2软件筛选,筛选阈值为对数2倍变化(log2 fold change, FC)≠0且错误发现率(false discovery rate, FDR)≤0.01。
提供机构:
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创建时间:
2023-01-23
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