Analyzed smFISH Dataset

This datatable contains all excitatory cells (slc17a7+) across anterior, intermediate, and posterior sections of the basolateral amygdala. Metadata includes:- gene: denotes gene expressed within given cell- quant: quantified expression of a given gene, normalized so that quantification of each gene adds to 1 for a given cell- X & Y: cell position in space- position: denotes which section the cells came from (anterior intermediate, or posterior)- tsne1 & tsne2: plot these to get tsne visualization (perplexity = 35, max iteration = 6350)- cluster: cells labelled cluster 1-6 - according to hierarchical clustering (distance = Euclidean, method = Ward D2)

本数据表收录了基底外侧杏仁核（basolateral amygdala）前、中、后三个亚区中所有slc17a7阳性的兴奋性细胞。其配套元数据包含以下内容：
- 基因（gene）：指代指定细胞内表达的基因
- 量化值（quant）：指定基因的量化表达水平，经标准化处理后，单个细胞内所有基因的量化值之和为1
- X与Y坐标：细胞的空间位置坐标
- 分区（position）：标注细胞所属的组织亚区（前部、中部或后部）
- t-SNE维度1（tsne1）与t-SNE维度2（tsne2）：绘制这两个维度即可生成t分布邻域嵌入（t-SNE）可视化结果，其中困惑度（perplexity）设置为35，最大迭代次数为6350
- 聚类标签（cluster）：基于层次聚类（hierarchical clustering）结果将细胞划分为1至6共6个聚类，该聚类以欧氏距离（Euclidean）作为距离度量标准，聚类方法为Ward D2