Gene sequences for the 9,530 MAGs in the 953-species dataset

This dataset contains the gene sequences for the 9,530 MAGs used in the paper "Using lossless compression algorithms to improve metagenomics binning and accelerate genome taxonomic classification" by Meir et al., 2024.MAGs in this dataset were collected from these studies:Pasolli E, Asnicar F, Manara S, Zolfo M, Karcher N, Armanini F, et al. Extensive Unexplored Human Microbiome Diversity Revealed by Over 150,000 Genomes from Metagenomes Spanning Age, Geography, and Lifestyle. Cell. 2019 Jan 24;176(3):649-662.e20.Almeida A, Nayfach S, Boland M, Strozzi F, Beracochea M, Shi ZJ, et al. A unified sequence catalogue of over 200,000 genomes obtained from the human gut microbiome. Nature Biotechnology. 2021 Jan; 39(1):105-114Forster SC, Kumar N, Anonye BO, Almeida A, Viciani E, Stares MD, et al. A human gut bacterial genome and culture collection for improved metagenomic analyses. Nature Biotechnology. 2019 Feb 04; 37(2) 186-192

本数据集包含Meir等人2024年发表的论文《使用无损压缩算法优化宏基因组分箱并加速基因组分类学分类》中所使用的9530个宏基因组组装基因组（Metagenome-Assembled Genome，MAG）的基因序列。本数据集的宏基因组组装基因组来源于以下研究：
Pasolli E、Asnicar F、Manara S、Zolfo M、Karcher N、Armanini F等. 跨越年龄、地域与生活方式的宏基因组中超过15万个基因组揭示了大量未被探索的人类微生物组多样性. 《细胞（Cell）》. 2019年1月24日;176(3):649-662.e20.
Almeida A、Nayfach S、Boland M、Strozzi F、Beracochea M、Shi ZJ等. 源自人类肠道微生物组的超过20万个基因组的统一序列目录. 《自然-生物技术（Nature Biotechnology）》. 2021年1月;39(1):105-114.
Forster SC、Kumar N、Anonye BO、Almeida A、Viciani E、Stares MD等. 用于优化宏基因组分析的人类肠道细菌基因组与培养物集合. 《自然-生物技术（Nature Biotechnology）》. 2019年2月4日;37(2):186-192