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10x Single-Cell RNAseq PBMCs (Withheld Test Set)

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DataCite Commons2025-04-01 更新2024-07-29 收录
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资源简介:
Human CD4, CD8, CD14, and NK cells (100 of each, withheld from a larger reference set) in a SingleCellExperiment object with annotation labels. This dataset is used as a test set for cell-type annotation classifiers. These cells are compiled from data downloaded from the 10x website, and originate from the following publication:<br> <br> <br> Zheng, G. X., Terry, J. M., Belgrader, P., Ryvkin, P., Bent, Z. W., Wilson, R., ... &amp; Bielas, J. H. (2017). Massively parallel digital transcriptional profiling of single cells. <em>Nature communications</em>, <em>8</em>(1), 1-12.

本数据集包含从大型参考集中预留的各100个人类CD4、CD8、CD14阳性细胞及自然杀伤(NK)细胞,所有细胞均存储于带有注释标签的SingleCellExperiment对象中。该数据集被用作细胞类型注释分类器的测试集。 这批细胞由从10x官网下载的数据汇编而成,其原始文献如下: 郑,G. X.、特里,J. M.、贝尔格拉德,P.、雷夫金,P.、本特,Z. W.、威尔逊,R. 等与比拉斯,J. H.(2017)。大规模并行数字化单细胞转录组分析。《自然·通讯》(Nature Communications),8(1),1-12.
提供机构:
figshare
创建时间:
2022-04-26
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