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Additional file 2: Table S1. of A comprehensive hybridization model allows whole HERV transcriptome profiling using high density microarray

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Figshare2017-04-09 更新2026-04-08 收录
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资源简介:
Chromosome locations of the prototypes used in HERVgDB4 generation. For each of the 70 prototypes associated with 42 HERV families, the family name, the sub-region annotation (full length provirus, int = gag + pol + env, LTRs, U3, R, U5 subdomains, and gag, pol, dUTPase, env genes), chromosome location (chromosome, start, end) and strand are provided. The 42 HERV families split into, 28 class I, 11 class II and 3 class III sub-families. (XLS 76 kb)

HERVgDB4构建过程中所用原型序列的染色体定位信息。针对关联于42个人类内源性逆转录病毒(HERV)家族的70个原型序列,本数据集提供了其家族名称、亚区域注释(涵盖全长前病毒、int = gag+pol+env区域、长末端重复序列(Long Terminal Repeats, LTRs)、U3、R、U5亚结构,以及gag、pol、dUTPase、env基因)、染色体定位(染色体编号、起始位点、终止位点)与链方向。该42个HERV家族可分为28个I类、11个II类及3个III类亚家族。(XLS格式,文件大小76 KB)
提供机构:
Jean-Baptiste Veyrieras
创建时间:
2017-04-09
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54 个
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