curated dataset MHC-Maer

Excel dataset for Mastomys erythroleucus caught in Nigeria as part of the study Olayemi et al. (XXX) Plos Neglected DiseasesSample_No: unique identifierSex: male (m) or female (f)ELWmg: eye lens weight in milligramsWeight: body mass in milligramsVillage: Samples municipalityGenus: Taxonomic genusspecies: Taxonomic speciesLASV_PCR: presence of active Lassavirus infection detectable via PCRLASV_IgG: previous Lassavirus infection detectable via antibodiesMaerMHCI*001-195: presence-absence matrix of all MHC alleles identified in M. erythroleucusNo_of_alleles: individual allelic MHC diversity as number of unique allelesST01-24: presence-absence matrix of all MHC supertypes identified in M. erythroleucusNo_of_STs: individual supertype MHC diversity as number of unique supertypes

本数据集为Olayemi等（XXX）发表于《Plos Neglected Diseases》的研究中，于尼日利亚捕获的红颊马岛鼠（Mastomys erythroleucus）相关的Excel格式数据集
样本编号（Sample_No）：唯一识别码
性别（Sex）：雄性（m）或雌性（f）
眼晶状体重量（ELWmg）：以毫克为单位的眼晶状体质量
体质量（Weight）：以毫克为单位的个体体质量
采样村落（Village）：样本采集的行政村落
属（Genus）：分类学属级单元
物种（species）：分类学物种类群
拉沙病毒PCR检测结果（LASV_PCR）：可通过聚合酶链式反应（PCR）检测的活动性拉沙病毒（Lassa virus, LASV）感染状态
拉沙病毒IgG抗体检测结果（LASV_IgG）：可通过抗体检测确认的既往拉沙病毒感染状态
MaerMHCI*001-195：红颊马岛鼠（Mastomys erythroleucus）中已鉴定的所有主要组织相容性复合体（Major Histocompatibility Complex, MHC）等位基因的存在-缺失矩阵
等位基因数量（No_of_alleles）：个体的MHC等位基因多样性，以独特等位基因的数量计算
ST01-24：红颊马岛鼠（Mastomys erythroleucus）中已鉴定的所有MHC超型的存在-缺失矩阵
超型数量（No_of_STs）：个体的MHC超型多样性，以独特超型的数量计算