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Pond water SIP fraction microbial communities from Walnut Creek, CA, United States - JGIPond_A_00pct_50ng_3_1.7421 metagenome. pond metagenome

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NIAID Data Ecosystem2026-03-13 收录
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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA878289
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资源简介:
SIP metagenome fraction of pond sample from Joint Genome Institute, Walnut Creek spiked with Pseudomonas putida & Escherichia coli bacterial isolates (for each isolate 50ng of DNA labeled at 00pct with C13 were added); replicate number 3. This fraction has a SIP fraction number 7 and DNA density of 1.7421 g/uL. This is part of a larger study to identify the limit of detection of JGI SIP metagenomics pipeline.

本样本为取自位于核桃溪的联合基因组研究所(Joint Genome Institute, JGI)的池塘样本的稳定同位素探针(Stable Isotope Probing, SIP)宏基因组组分,向其中掺入了恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)与大肠杆菌(Escherichia coli)的细菌分离株——每株分离株均添加了50ng经0% C13标记的DNA;该样本为第3次重复样本。 该组分的SIP分级编号为7,DNA密度为1.7421 g/μL。 本样本属于一项旨在验证JGI SIP宏基因组学流程检出限的大型研究的组成部分。
创建时间:
2022-09-08
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