five

spatialRNAseq_heart_processed_suppdata.zip

收藏
DataCite Commons2025-06-01 更新2024-07-28 收录
下载链接:
https://figshare.com/articles/dataset/spatialRNAseq_heart_processed_suppdata_zip/17087756/1
下载链接
链接失效反馈
官方服务:
资源简介:
Processed H&amp;E images (JPG), tissue spot position list (CSV), and scale factor (JSON) files for 10x Genomics Visium spatial transcriptomics experiments for reovirus infected heart tissues. These files are processed files which can directly loaded in Seurat/ scanpy with the count matrices for spatial trasncriptomics analysis. If you want to realign the sequecning data, please download the rawsuppdata (ZIP) instead.<br>

本数据集包含用于呼肠孤病毒(Reovirus)感染心脏组织的10x Genomics Visium空间转录组实验的处理后文件,具体包括:苏木精-伊红(Hematoxylin-Eosin,H&E)染色图像(JPG格式)、组织斑点位置列表(CSV格式)以及缩放因子文件(JSON格式)。上述文件为预处理完成的数据集,可直接与计数矩阵一同导入Seurat/scanpy中开展空间转录组学分析。若需对测序数据进行重新比对,请转而下载原始补充数据(ZIP格式压缩包)。
提供机构:
figshare
创建时间:
2021-11-28
5,000+
优质数据集
54 个
任务类型
进入经典数据集
二维码
社区交流群

面向社区/商业的数据集话题

二维码
科研交流群

面向高校/科研机构的开源数据集话题

数据驱动未来

携手共赢发展

商业合作