Kellenberger_etal_overdominance_TWAS_dataset.vcf.gz

Study:Emergence of a floral colour polymorphism by pollinator-mediated overdominance<br>Authors:Roman T. Kellenberger, Kelsey J.R.P. Byers, Rita M. De Brito Francisco, Yannick M. Städler, Amy M. LaFountain, Jürg Schönenberger, Florian P. Schiestl, Philipp M. Schlüter<br>md5 (gzip): a009fcadfe823e349172394ce097d3aa<br>md5 (uncompressed): <br>8081a0b6ab1901c2f8ce6ac73ab4ef75<br><br>Content:gzip-compressed vcf file containing sequence variation data per transcript and <i>Gymnadenia </i>plant individual extracted from the corresponding Lexogen QuantSeq dataset.<br>Sample species:GdKB: <i>Gymnadenia conopsea</i>NrRTK: <i>Gymnadenia rhellicani</i><br>Sample origin / population:GdKB1: Davos, SwitzerlandGdKB2: Preda, Switzerland<br>GdKB3: Tschierv, Switzerland<br>NrRTK3 and NrRTK4: Puflatsch, ItalyNrRTK5: Chandolin, SwitzerlandNrRTK9: Ofenpass, Switzerland<br>Flower colour per <i>G. rhellicani</i> sample:NrRTK3A - WhiteNrRTK3A2 - RedNrRTK3A3 - Yellow<br>NrRTK3B - WhiteNrRTK3B2 - BlackNrRTK3C - BlackNrRTK3C2 - BlackNrRTK3D - WhiteNrRTK3D2 - RedNrRTK3F - RedNrRTK3G - BlackNrRTK3H - BlackNrRTK3H2 - RedNrRTK3I - RedNrRTK3K - BlackNrRTK3M - RedNrRTK3N - WhiteNrRTK3O - RedNrRTK3P - BlackNrRTK3Q - BlackNrRTK3R - BlackNrRTK3S - RedNrRTK3T - WhiteNrRTK3U - WhiteNrRTK3V - WhiteNrRTK3W - WhiteNrRTK3X - WhiteNrRTK3Y - WhiteNrRTK3Z - WhiteNrRTK4A - WhiteNrRTK4B - RedNrRTK4C - BlackNrRTK4D - RedNrRTK4E - BlackNrRTK4F - RedNrRTK4H - RedNrRTK4I - BlackNrRTK4K - RedNrRTK4L - RedNrRTK4M - BlackNrRTK4N - WhiteNrRTK4O - WhiteNrRTK4P - BlackNrRTK4Q - WhiteNrRTK5A - YellowNrRTK5A2 - YellowNrRTK5B - BlackNrRTK5B2 - BlackNrRTK5C - BrightNrRTK5C2 - BlackNrRTK5D2 - BrightNrRTK5E - BrightNrRTK5E2 - BlackNrRTK5F - BlackNrRTK5F2 - BrightNrRTK5G - BrightNrRTK5H - BlackNrRTK5I - BrightNrRTK5K - BlackNrRTK5L - BrightNrRTK5O - BlackNrRTK5P - BrightNrRTK5Q - BlackNrRTK5R - BrightNrRTK5S - BlackNrRTK5T - YellowNrRTK5U - YellowNrRTK5V - BlackNrRTK5Y - BrightNrRTK5Z - BlackNrRTK9A - BlackNrRTK9D - BlackNrRTK9L - BlackNrRTK9M - BlackNrRTK9N - BlackNrRTK9P - Black<br>

研究：传粉媒介介导的超显性引发花卉颜色多态性<br>作者：罗曼·T. 凯伦贝格尔（Roman T. Kellenberger）、凯尔西·J.R.P. 拜尔斯（Kelsey J.R.P. Byers）、丽塔·M. 德·布里托·弗朗西斯科（Rita M. De Brito Francisco）、扬尼克·M. 施塔德勒（Yannick M. Städler）、艾米·M. 拉方丹（Amy M. LaFountain）、于尔格·舍嫩贝格尔（Jürg Schönenberger）、弗洛里安·P. 希斯特尔（Florian P. Schiestl）、菲利普·M. 施吕特（Philipp M. Schlüter）<br>gzip压缩版MD5：a009fcadfe823e349172394ce097d3aa<br>未压缩版MD5：8081a0b6ab1901c2f8ce6ac73ab4ef75<br><br>内容：经gzip压缩的VCF（Variant Call Format）文件，包含源自对应Lexogen QuantSeq测序数据集的、每个转录本及手兰属（*Gymnadenia*）植物个体的序列变异数据<br>样本物种：GdKB：手参（*Gymnadenia conopsea*）；NrRTK：瑞士手参（*Gymnadenia rhellicani*）<br>样本来源/采样种群：GdKB1：瑞士达沃斯（Davos）；GdKB2：瑞士普雷达（Preda）；GdKB3：瑞士切尔夫（Tschierv）；NrRTK3、NrRTK4：意大利普弗拉奇（Puflatsch）；NrRTK5：瑞士尚多兰（Chandolin）；NrRTK9：瑞士奥芬山口（Ofenpass）<br>瑞士手参（*Gymnadenia rhellicani*）样本对应花色信息：<br>NrRTK3A - 白色；NrRTK3A2 - 红色；NrRTK3A3 - 黄色；NrRTK3B - 白色；NrRTK3B2 - 黑色；NrRTK3C - 黑色；NrRTK3C2 - 黑色；NrRTK3D - 白色；NrRTK3D2 - 红色；NrRTK3F - 红色；NrRTK3G - 黑色；NrRTK3H - 黑色；NrRTK3H2 - 红色；NrRTK3I - 红色；NrRTK3K - 黑色；NrRTK3M - 红色；NrRTK3N - 白色；NrRTK3O - 红色；NrRTK3P - 黑色；NrRTK3Q - 黑色；NrRTK3R - 黑色；NrRTK3S - 红色；NrRTK3T - 白色；NrRTK3U - 白色；NrRTK3V - 白色；NrRTK3W - 白色；NrRTK3X - 白色；NrRTK3Y - 白色；NrRTK3Z - 白色；NrRTK4A - 白色；NrRTK4B - 红色；NrRTK4C - 黑色；NrRTK4D - 红色；NrRTK4E - 黑色；NrRTK4F - 红色；NrRTK4H - 红色；NrRTK4I - 黑色；NrRTK4K - 红色；NrRTK4L - 红色；NrRTK4M - 黑色；NrRTK4N - 白色；NrRTK4O - 白色；NrRTK4P - 黑色；NrRTK4Q - 白色；NrRTK5A - 黄色；NrRTK5A2 - 黄色；NrRTK5B - 黑色；NrRTK5B2 - 黑色；NrRTK5C - 亮色；NrRTK5C2 - 黑色；NrRTK5D2 - 亮色；NrRTK5E - 亮色；NrRTK5E2 - 黑色；NrRTK5F - 黑色；NrRTK5F2 - 亮色；NrRTK5G - 亮色；NrRTK5H - 黑色；NrRTK5I - 亮色；NrRTK5K - 黑色；NrRTK5L - 亮色；NrRTK5O - 黑色；NrRTK5P - 亮色；NrRTK5Q - 黑色；NrRTK5R - 亮色；NrRTK5S - 黑色；NrRTK5T - 黄色；NrRTK5U - 黄色；NrRTK5V - 黑色；NrRTK5Y - 亮色；NrRTK5Z - 黑色；NrRTK9A - 黑色；NrRTK9D - 黑色；NrRTK9L - 黑色；NrRTK9M - 黑色；NrRTK9N - 黑色；NrRTK9P - 黑色