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Additional file 1 of TAMA: improved metagenomic sequence classification through meta-analysis

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Mendeley Data2024-06-25 更新2024-06-27 收录
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Additional file 1: Supplementary Table S1. The statistics of reference sequences used in the TAMA database. Supplementary Table S2. The relative abundance of 10 genomes generated using six different parameter values of the Poisson distribution. Supplementary Table S3. The relative abundance of 50 genomes generated using seven different parameter values of the Poisson distribution. Supplementary Table S4. The relative abundance of 100 genomes generated using seven different parameter values of the Poisson distribution. Supplementary Table S5. The statistics of read sequences in real metagenome datasets. Supplementary Table S6. The abundance difference of initial taxonomy analysis tools and TAMA for the simulated metagenome datasets. Supplementary Table S7. The abundance profile of Artisanal cheese metagenome. Supplementary Table S8. The abundance profile of Cotija cheese metagenome. Supplementary Table S9. The abundance profile of human gut metagenome.

附加文件1:补充表S1。TAMA数据库所用参考序列的统计信息。补充表S2:采用6组不同参数的泊松(Poisson)分布生成的10个基因组的相对丰度情况。补充表S3:采用7组不同参数的泊松(Poisson)分布生成的50个基因组的相对丰度情况。补充表S4:采用7组不同参数的泊松(Poisson)分布生成的100个基因组的相对丰度情况。补充表S5:真实宏基因组(metagenome)数据集的测序读段序列统计信息。补充表S6:模拟宏基因组数据集下,初始分类分析工具与TAMA的丰度差异对比结果。补充表S7:手工奶酪宏基因组的丰度谱信息。补充表S8:科蒂亚(Cotija)奶酪宏基因组的丰度谱信息。补充表S9:人类肠道宏基因组的丰度谱信息。
创建时间:
2023-06-28
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