Metabolic Atlas

Metabolic Atlas is a web platform integrating open-source genome scale metabolic models (GEMs) for easy browsing and analysis. The goal is to collect curated GEMs, and to bring these models closer to FAIR principles. The website provides visualisations and comparisons of the GEMs, and links to resources, algorithms, other databases, and more general software applications. Metabolic Atlas is intended to be used for applications in metabolomics, clinical chemistry, biomarker discovery and general education. In short, the vision is to create a one-stop-shop for everything metabolism related.代谢图谱库（Metabolic Atlas）是一款集成开源基因组规模代谢模型（genome scale metabolic models, GEMs）的网页平台，可为用户提供便捷的浏览与分析服务。其核心目标为收录经过人工审核整理的GEMs，并推动这些模型更契合FAIR原则（FAIR principles）。该平台可提供GEMs的可视化展示与对比分析功能，并附带各类研究资源、算法工具、其他数据库以及通用软件应用的跳转链接。代谢图谱库可应用于代谢组学、临床化学、生物标志物发现以及通识教育等多个研究与教学场景。简言之，其愿景是打造一个覆盖所有代谢相关研究内容的一站式服务平台。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Metabolic Atlas是一个整合开源基因组尺度代谢模型（GEMs）的Web平台，旨在通过可视化、比较和链接资源等功能，推动代谢模型向FAIR原则靠拢。该平台支持代谢组学、临床化学和生物标志物发现等应用，致力于成为代谢研究的一站式中心。