E. coli PopPUNK Database - complete
收藏DataCite Commons2020-08-25 更新2024-07-28 收录
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资源简介：
PopPUNK database which can be used to query any genome and examine its context relative to the E. coli dataset.<br>To use: download both parts, unzip into a single directory named "ecoli_poppunk_db" and run using:<br>poppunk --assign-query --ref-db ecoli_poppunk_db --q-files list_of_genomes.txt --output output_dir<br>**Built using PopPUNK version 1.1.3**
本数据集为PopPUNK数据库（PopPUNK），可用于对任意基因组进行查询，并分析其与大肠杆菌（E. coli）数据集的关联背景。
使用方法如下：下载全部两个分卷文件，解压至名为"ecoli_poppunk_db"的单一目录中，并通过以下命令运行：
poppunk --assign-query --ref-db ecoli_poppunk_db --q-files list_of_genomes.txt --output output_dir
**本数据库基于PopPUNK 1.1.3版本构建**
提供机构：
figshare
创建时间：
2020-07-14
